RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468069.1

RPS6KC1-203, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

TSL 3

Gene RPS6KC1, Length 784 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-203ENST00000468069 STRN3Q13033 797 aa6□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 TRIM29Q14134 588 aa6□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 MYBPC2Q14324 1141 aa6□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 COL28A1Q2UY09 1125 aa6□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 SDHAF4Q5VUM1 108 aa6□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 C1QL3Q5VWW1 255 aa6□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 SYT13Q7L8C5 426 aa6□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 MRGPREQ86SM8 312 aa6□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 UNC5BQ8IZJ1 945 aa6□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 DAW1Q8N136 415 aa6□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 NXPE1Q8N323 547 aa6□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 CPA6Q8N4T0 437 aa6□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 DEFB119Q8N690 84 aa6□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 FRMD1Q8N878 549 aa6□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 OR5M3Q8NGP4 307 aa6□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 OR2I1PQ8NGU4 316 aa6□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 CD101Q93033 1021 aa6□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 BICD1Q96G01 975 aa6□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 SENP8Q96LD8 212 aa6□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 CYP2S1Q96SQ9 504 aa6□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 SLC32A1Q9H598 525 aa6□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa6□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa6□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 APC2O95996 2303 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 EML5Q05BV3 1969 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 TTC26A0AVF1 554 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 PP2D1A8MPX8 630 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 CLDN3O15551 220 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 TOM1L1O75674 476 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 CLTAP09496 248 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 ODC1P11926 461 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 XPAP23025 273 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 LRPAP1P30533 357 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 IFNAR2P48551 515 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 TUFMP49411 452 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 LILRA4P59901 499 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 MTF1Q14872 753 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 PDGFRLQ15198 375 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 FBXO43Q4G163 708 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 HAUS3Q68CZ6 603 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 Q6ZPA2 131 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 LPCAT2Q7L5N7 544 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 TMEM150AQ86TG1 271 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 LRRTM3Q86VH5 581 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 SFTPA1Q8IWL2 248 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 CDYL2Q8N8U2 506 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 PNPLA1Q8N8W4 532 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 CHTF18Q8WVB6 975 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 ATP2A3Q93084 1043 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 ERLEC1Q96DZ1 483 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 LRIG1Q96JA1 1093 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 CAMK1GQ96NX5 476 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 PI4K2AQ9BTU6 479 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 TM6SF1Q9BZW5 370 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 LINC00597Q9H2U6 94 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 ECT2Q9H8V3 914 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 TMEM74BQ9NUR3 256 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 LRWD1Q9UFC0 647 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 TBX20Q9UMR3 447 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 CFAP46Q8IYW2 2715 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 ASXL3Q9C0F0 2248 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 TENM4Q6N022 2769 aa5.99□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 ACACAQ13085 2346 aa5.98□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 CYB561D2O14569 222 aa5.98□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 TYMPP19971 482 aa5.98□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 CDC25AP30304 524 aa5.98□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP5.98□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 CD69Q07108 199 aa5.98□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 MCL1Q07820 350 aa5.98□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 SCAPQ12770 1279 aa5.98□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 LMAN2Q12907 356 aa5.98□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 MAPK7Q13164 816 aa5.98□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 ZBTB6Q15916 424 aa5.98□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.98□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 LY6G5CQ5SRR4 150 aa5.98□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 C9orf57Q5W0N0 161 aa5.98□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 WSCD1Q658N2 575 aa5.98□□□□□ -1.45
RPS6KC1-203ENST00000468069 JADE1Q6IE81 842 aa5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms