RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462256.5

DDX39B-215, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 4,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-215ENST00000462256 ZP2Q05996 745 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-215ENST00000462256 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-215ENST00000462256 CENPUQ71F23 418 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-215ENST00000462256 CCDC185Q8N715 623 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-215ENST00000462256 HTR3CQ8WXA8 447 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-215ENST00000462256 CFAP36Q96G28 342 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-215ENST00000462256 RNF157Q96PX1 679 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-215ENST00000462256 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-215ENST00000462256 EPS15L1Q9UBC2 864 aa9.4□□□□□ -0.9
DDX39B-215ENST00000462256 FOCADQ5VW36 1801 aa9.4□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa9.4□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 TM7SF2O76062 418 aa9.4□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 TUBBP07437 444 aa9.4□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 ANXA6P08133 673 aa9.4□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 ZXDAP98168 799 aa9.4□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa9.4□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 OR2T3Q8NH03 318 aa9.4□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 CFAP61Q8NHU2 1237 aa9.4□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 PYROXD1Q8WU10 500 aa9.4□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 KLHDC7BQ96G42 594 aa9.4□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 PCDH18Q9HCL0 1135 aa9.4□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 GDF3Q9NR23 364 aa9.4□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 TLK1Q9UKI8 766 aa9.4□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 NARSO43776 548 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 GLP2RO95838 553 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 EZRP15311 586 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 AMD1P17707 334 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 CD86P42081 329 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 AP1ARQ63HQ0 302 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 C11orf63Q6NUN7 778 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 TAF8Q7Z7C8 310 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 HID1Q8IV36 788 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 OR2AP1Q8NGE2 309 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 HMCESQ96FZ2 354 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 DNAJC28Q9NX36 388 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 IL36AQ9UHA7 158 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 A0A1W2PP55 124 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 HACD1B0YJ81 288 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 RNF103O00237 685 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 CTPS1P17812 591 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 SLC6A11P48066 632 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 RPIAP49247 311 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 FNTBP49356 437 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 RHBDF2Q6PJF5 856 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 POLNQ7Z5Q5 900 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 ATP6V1E2Q96A05 226 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 FAM122AQ96E09 287 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 MYO19Q96H55 970 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 SCYL1Q96KG9 808 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 CSPG4P5Q96PW8 444 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 CARD9Q9H257 536 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 HSD3B7Q9H2F3 369 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 ATP8B1O43520 1251 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 LRCH4O75427 683 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 TMCC1O94876 653 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 SEMA4FO95754 770 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 OAS1P00973 400 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 INHBAP08476 426 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 TNFRSF4P43489 277 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 PTPN5P54829 565 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 PLTPP55058 493 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 XRCC4Q13426 336 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 C22orf39Q6P5X5 142 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 FIBINQ8TAL6 211 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 EDAQ92838 391 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 NCANO14594 1321 aa9.39□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 AGRPO00253 132 aa9.38□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 CCR2P41597 374 aa9.38□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF132P52740 706 aa9.38□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 IL10RBQ08334 325 aa9.38□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 PRKAA1Q13131 559 aa9.38□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 MMRN1Q13201 1228 aa9.38□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 GDPD4Q6W3E5 623 aa9.38□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 BEND5Q7L4P6 421 aa9.38□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 ADCK2Q7Z695 626 aa9.38□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 PYROXD2Q8N2H3 581 aa9.38□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 CPXM2Q8N436 756 aa9.38□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 LMO3Q8TAP4 145 aa9.38□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 CHFRQ96EP1 664 aa9.38□□□□□ -0.91
DDX39B-215ENST00000462256 OSBPL6Q9BZF3 934 aa9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms