RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455580.5

PPP1CB-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PPP1CB, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CB-208ENST00000455580 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
PPP1CB-208ENST00000455580 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
PPP1CB-208ENST00000455580 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa24.41■■□□□ 1.5
PPP1CB-208ENST00000455580 KLHDC7BQ96G42 594 aa24.41■■□□□ 1.5
PPP1CB-208ENST00000455580 FEM1CQ96JP0 617 aa24.41■■□□□ 1.5
PPP1CB-208ENST00000455580 KLC2Q9H0B6 622 aa24.41■■□□□ 1.5
PPP1CB-208ENST00000455580 FADS3Q9Y5Q0 445 aa24.41■■□□□ 1.5
PPP1CB-208ENST00000455580 TMEM8BA6NDV4 472 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP1CB-208ENST00000455580 RASA4BC9J798 803 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP1CB-208ENST00000455580 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
PPP1CB-208ENST00000455580 RASA4O43374 803 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP1CB-208ENST00000455580 AP1G1O43747 822 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP1CB-208ENST00000455580 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
PPP1CB-208ENST00000455580 GKP32189 559 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP1CB-208ENST00000455580 PBX1P40424 430 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP1CB-208ENST00000455580 SERINC3Q13530 473 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP1CB-208ENST00000455580 TMEM259Q4ZIN3 620 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP1CB-208ENST00000455580 SEL1L3Q68CR1 1132 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP1CB-208ENST00000455580 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF354CQ86Y25 554 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP1CB-208ENST00000455580 OR6K2Q8NGY2 324 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP1CB-208ENST00000455580 FNIP1Q8TF40 1166 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP1CB-208ENST00000455580 HMCESQ96FZ2 354 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP1CB-208ENST00000455580 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa24.4■■□□□ 1.5
PPP1CB-208ENST00000455580 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
PPP1CB-208ENST00000455580 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
PPP1CB-208ENST00000455580 CACNA1BQ00975 2339 aa24.39■■□□□ 1.5
PPP1CB-208ENST00000455580 GOLGA8CPA6NN73 597 aa24.39■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 C16orf96A6NNT2 1141 aa24.39■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 AKT2P31751 481 aa24.39■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 RPS21P63220 83 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 PARP15Q460N3 678 aa24.39■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF805Q5CZA5 627 aa24.39■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 ERMARDQ5T6L9 678 aa24.39■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 MYOCQ99972 504 aa24.39■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 TRIM7Q9C029 511 aa24.39■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 ISCUQ9H1K1 167 aa24.39■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 FTSJ1Q9UET6 329 aa24.39■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 AP4E1Q9UPM8 1137 aa24.39■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 A0A1W2PQJ5 194 aa24.38■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 KRIT1O00522 736 aa24.38■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 RNF8O76064 485 aa24.38■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 TMCC1O94876 653 aa24.38■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 THEGLP0DJG4 465 aa24.38■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 UBASH3AP57075 661 aa24.38■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 TPI1P60174 286 aa24.38■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 CA9Q16790 459 aa24.38■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 HGSNATQ68CP4 663 aa24.38■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa24.38■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa24.38■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa24.38■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 RAB7BQ96AH8 199 aa24.38■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF653Q96CK0 615 aa24.38■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa24.38■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 SLC17A9Q9BYT1 436 aa24.38■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 LRRC19Q9H756 370 aa24.38■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 FZD3Q9NPG1 666 aa24.38■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 DONSONQ9NYP3 566 aa24.38■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 PCSK1NQ9UHG2 260 aa24.38■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa24.38■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 ASPMQ8IZT6 3477 aa24.38■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 MYBL1P10243 752 aa24.37■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 MIPP30301 263 aa24.37■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 FGL2Q14314 439 aa24.37■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa24.37■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 EID2Q8N6I1 236 aa24.37■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 TRIM11Q96F44 468 aa24.37■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa24.37■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 PEBP4Q96S96 227 aa24.37■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa24.37■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa24.37■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 SCINQ9Y6U3 715 aa24.37■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 TSPAN6O43657 245 aa24.36■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 UGT2B4P06133 528 aa24.36■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 ABL2P42684 1182 aa24.36■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 NDST2P52849 883 aa24.36■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 CLDN2P57739 230 aa24.36■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 RAD51Q06609 339 aa24.36■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 CYTH1Q15438 398 aa24.36■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 GDPD4Q6W3E5 623 aa24.36■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 GCNT7Q6ZNI0 430 aa24.36■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 ZSCAN30Q86W11 494 aa24.36■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 NETO2Q8NC67 525 aa24.36■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 FAM174AQ8TBP5 190 aa24.36■■□□□ 1.49
PPP1CB-208ENST00000455580 BMFQ96LC9 184 aa24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms