RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442250.5

ITGA6-206, Transcript of integrin subunit alpha 6, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ITGA6, Length 3,393 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6-206ENST00000442250 SNX32Q86XE0 403 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 TNS4Q8IZW8 715 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 DDI1Q8WTU0 396 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 CMTM5Q96DZ9 223 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 CYP3A43Q9HB55 503 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 THAP1Q9NVV9 213 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa9.5□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 PLOD2O00469 737 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 DENRO43583 198 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 ZBTB14O43829 449 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 RFPL1O75677 317 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 FUCA1P04066 466 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 AXLP30530 894 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 SOX11P35716 441 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 CDKN2BP42772 138 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 DMPKQ09013 629 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 BNIP3Q12983 259 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 DPYSL3Q14195 570 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 PPM1JQ5JR12 505 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 SLC9A4Q6AI14 798 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 LRRC8DQ7L1W4 858 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 MAVSQ7Z434 540 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 KDELC2Q7Z4H8 507 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 PCGF5Q86SE9 256 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 C10orf107Q8IVU9 208 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 ZNF786Q8N393 782 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 AUTS2Q8WXX7 1259 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 C1orf21Q9H246 121 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 PPCSQ9HAB8 311 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 Q9Y3F1 56 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 TET1Q8NFU7 2136 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 A0A1W2PPW3 197 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 MDM4O15151 490 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 ITGAVP06756 1048 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 C21orf59P57076 290 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 PTP4A2Q12974 167 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 ITGADQ13349 1161 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 ARHGEF6Q15052 776 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 KYAT1Q16773 422 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 MGAT5BQ3V5L5 792 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 GPR107Q5VW38 600 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 SYPL2Q5VXT5 272 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 CYP2R1Q6VVX0 501 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 SH2D5Q6ZV89 423 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 MIB1Q86YT6 1006 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 AHI1Q8N157 1196 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 CXorf38Q8TB03 319 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 GIPC2Q8TF65 315 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 ATP6V1E2Q96A05 226 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 COX4I2Q96KJ9 171 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 CIB1Q99828 191 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 CRTAC1Q9NQ79 661 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 SACM1LQ9NTJ5 587 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 TMEM39AQ9NV64 488 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 ADA2Q9NZK5 511 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 SNX13Q9Y5W8 968 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 FBXO21O94952 628 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 CLIC3O95833 236 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 MX2P20592 715 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 PHEXP78562 749 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 XIAPP98170 497 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 GNA12Q03113 381 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 SEPT6Q14141 434 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 ADGRE1Q14246 886 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 CARTPTQ16568 116 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 LGSNQ5TDP6 509 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 TRNP1Q6NT89 227 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 PGM2L1Q6PCE3 622 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 CENPSQ8N2Z9 138 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 TTC9BQ8N6N2 239 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 DDHD1Q8NEL9 900 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 KLHDC9Q8NEP7 349 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 CASP10Q92851 521 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 MYLPFQ96A32 169 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 SLX1AQ9BQ83 275 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 COQ10BQ9H8M1 238 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 TMLHEQ9NVH6 421 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 ASNSD1Q9NWL6 643 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 SIRPGQ9P1W8 387 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 VPS51Q9UID3 782 aa9.49□□□□□ -0.89
ITGA6-206ENST00000442250 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62 ms