RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428982.4

SYNGAP1-203, Transcript of synaptic Ras GTPase activating protein 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SYNGAP1, Length 4,339 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1-203ENST00000428982 CDK2AP1O14519 115 aa14.6□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 MAGP20916 626 aa14.6□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 ACOT2P49753 483 aa14.6□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 CPT1AP50416 773 aa14.6□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 OSTNP61366 133 aa14.6□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 UGT3A1Q6NUS8 523 aa14.6□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 RHBDF2Q6PJF5 856 aa14.6□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 GPR142Q7Z601 462 aa14.6□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 TMEM9Q9P0T7 183 aa14.6□□□□□ -0.07
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SYNGAP1-203ENST00000428982 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa14.6□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 H3BMQ9 156 aa14.6□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 DCXO43602 365 aa14.6□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 HSPA4LO95757 839 aa14.6□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 ATF6P18850 670 aa14.6□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 SERPINB5P36952 375 aa14.6□□□□□ -0.07
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SYNGAP1-203ENST00000428982 TAF5Q15542 800 aa14.6□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 LLGL2Q6P1M3 1020 aa14.6□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 CYP20A1Q6UW02 462 aa14.6□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 OTOP3Q7RTS5 596 aa14.6□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 SLC51BQ86UW2 128 aa14.6□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 DAW1Q8N136 415 aa14.6□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 BRSK1Q8TDC3 778 aa14.6□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 PIK3R3Q92569 461 aa14.6□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 COG8Q96MW5 612 aa14.6□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa14.6□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa14.59□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 TMEM88BA6NKF7 163 aa14.59□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 SEC24AO95486 1093 aa14.59□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 IFI30P13284 250 aa14.59□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 HPCAL1P37235 193 aa14.59□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 NOMO3P69849 1222 aa14.59□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 MTM1Q13496 603 aa14.59□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 ZACNQ401N2 412 aa14.59□□□□□ -0.07
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SYNGAP1-203ENST00000428982 KCTD8Q6ZWB6 473 aa14.59□□□□□ -0.07
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SYNGAP1-203ENST00000428982 IFNL1Q8IU54 200 aa14.59□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa14.59□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 PEX13Q92968 403 aa14.59□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 YME1L1Q96TA2 773 aa14.59□□□□□ -0.07
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SYNGAP1-203ENST00000428982 POLHQ9Y253 713 aa14.59□□□□□ -0.07
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SYNGAP1-203ENST00000428982 SCYL2Q6P3W7 929 aa14.59□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 CASC4Q6P4E1 433 aa14.59□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 POLNQ7Z5Q5 900 aa14.59□□□□□ -0.07
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SYNGAP1-203ENST00000428982 AFG1LQ8WV93 481 aa14.59□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 HSPH1Q92598 858 aa14.59□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 CEP19Q96LK0 163 aa14.59□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 DMRTB1Q96MA1 342 aa14.59□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 MROQ9BYG7 248 aa14.59□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 COQ10BQ9H8M1 238 aa14.59□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 TRIM49D1C9J1S8 452 aa14.59□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 PDPK1O15530 556 aa14.59□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 RBL1P28749 1068 aa14.59□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 IL12AP29459 219 aa14.59□□□□□ -0.07
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SYNGAP1-203ENST00000428982 EFCAB12Q6NXP0 572 aa14.59□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 HMGXB4Q9UGU5 601 aa14.59□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 RRN3P2A6NIE6 340 aa14.58□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 TOR1BO14657 336 aa14.58□□□□□ -0.07
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SYNGAP1-203ENST00000428982 ZNF484Q5JVG2 852 aa14.58□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 GPAT2Q6NUI2 795 aa14.58□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 LRRC71Q8N4P6 559 aa14.58□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 TINF2Q9BSI4 451 aa14.58□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 STRA6Q9BX79 667 aa14.58□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 POLE4Q9NR33 117 aa14.58□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 NDFIP2Q9NV92 336 aa14.58□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 GRID1Q9ULK0 1009 aa14.58□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 PPME1Q9Y570 386 aa14.58□□□□□ -0.07
SYNGAP1-203ENST00000428982 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
SYNGAP1-203ENST00000428982 ZW10O43264 779 aa14.58□□□□□ -0.08
SYNGAP1-203ENST00000428982 SSTR1P30872 391 aa14.58□□□□□ -0.08
SYNGAP1-203ENST00000428982 RRM2P31350 389 aa14.58□□□□□ -0.08
SYNGAP1-203ENST00000428982 TYSND1Q2T9J0 566 aa14.58□□□□□ -0.08
SYNGAP1-203ENST00000428982 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa14.58□□□□□ -0.08
SYNGAP1-203ENST00000428982 FKBP9P1Q75LS8 142 aa14.58□□□□□ -0.08
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