RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423971.2

ACTBP13-201, Transcript of actin, beta pseudogene 13, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP13, Length 3,959 nt, Biotype unitary pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP13-201ENST00000423971 POU5F2Q8N7G0 328 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 CKAP2Q8WWK9 683 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 SERPINB12Q96P63 405 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 SLC39A3Q9BRY0 314 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 COLEC11Q9BWP8 271 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 APOL5Q9BWW9 433 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 MFN2O95140 757 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 PRKCGP05129 697 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 ALADP13716 330 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 CHRNA4P43681 627 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 MAPK10P53779 464 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 CYP1B1Q16678 543 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 PERM1Q5SV97 790 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 METTL21CQ5VZV1 264 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 SLC24A5Q71RS6 500 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 POLNQ7Z5Q5 900 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 OR6K2Q8NGY2 324 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 SLC35B2Q8TB61 432 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 SCYL1Q96KG9 808 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 EBF3Q9H4W6 596 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 CAB39LQ9H9S4 337 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 TRIM39Q9HCM9 518 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 NT5MQ9NPB1 228 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 ADAM12O43184 909 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 LPXNO60711 386 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 KCNE1P15382 129 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 NFKB1P19838 968 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 GPX6P59796 221 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 RGS21Q2M5E4 152 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 SLC25A52Q3SY17 297 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 TRIM60Q495X7 471 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 KLHL35Q6PF15 583 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 SLC26A9Q7LBE3 791 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 NT5DC4Q86YG4 428 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 OR6P1Q8NGX9 317 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 CCDC28BQ9BUN5 200 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 FSD1LQ9BXM9 530 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 GIT1Q9Y2X7 761 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 PLXNB2O15031 1838 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 EYSQ5T1H1 3165 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 PEX1O43933 1283 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 KLHL41O60662 606 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 PAGE1O75459 146 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 TNFAIP8O95379 198 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 TM4SF4P48230 202 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 CD97P48960 835 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 PLD1Q13393 1074 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 DNAL1Q4LDG9 190 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 LPCAT4Q643R3 524 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 ALKAL1Q6UXT8 129 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 PACS1Q6VY07 963 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 GPR141Q7Z602 305 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 ARPINQ7Z6K5 226 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 CMC1Q7Z7K0 106 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 NDUFAF2Q8N183 169 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 CRYBG2Q8N1P7 616 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 TOP6BLQ8N6T0 577 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 TCP10LQ8TDR4 215 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 NSMCE3Q96MG7 304 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 TSSK1BQ9BXA7 367 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 CCSER2Q9H7U1 834 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 PAK5Q9P286 719 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 GJB3O75712 270 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 MORF4L2Q15014 288 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 SLC1A5Q15758 541 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 MAPK11Q15759 364 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 ANO4Q32M45 955 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 PPM1JQ5JR12 505 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 C11orf74Q86VG3 221 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 ATPAF2Q8N5M1 289 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 NPWQ8N729 165 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 MCUQ8NE86 351 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 TSNARE1Q96NA8 513 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 PARP14Q460N5 1801 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 COPEO14579 308 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 TP73O15350 636 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 NBNO60934 754 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 ITGAVP06756 1048 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
ACTBP13-201ENST00000423971 SLC11A1P49279 550 aa8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms