RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ME1P48163 572 aa16.85■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATP1A2P50993 1020 aa16.85■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAPK10P53779 464 aa16.85■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CDH4P55283 916 aa16.85■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPARDQ03181 441 aa16.85■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AUHQ13825 339 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EDRF1Q3B7T1 1238 aa16.85■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CBWD6Q4V339 395 aa16.85■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CBWD3Q5JTY5 395 aa16.85■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CBWD5Q5RIA9 395 aa16.85■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C22orf39Q6P5X5 142 aa16.85■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MACC1Q6ZN28 852 aa16.85■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATCAYQ86WG3 371 aa16.85■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KYQ8NBH2 561 aa16.85■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAB7BQ96AH8 199 aa16.85■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VPS51Q9UID3 782 aa16.85■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VANGL2Q9ULK5 521 aa16.85■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRPM6Q9BX84 2022 aa16.85■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CREBBPQ92793 2442 aa16.85■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C9orf172C9J069 976 aa16.84■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RNF103O00237 685 aa16.84■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NEMP1O14524 444 aa16.84■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BRD2P25440 801 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TCERG1LQ5VWI1 586 aa16.84■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa16.84■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCNJLQ8IV13 435 aa16.84■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DCAF4L2Q8NA75 395 aa16.84■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PCDH19Q8TAB3 1148 aa16.84■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPBAR1Q8TDU6 330 aa16.84■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MED15Q96RN5 788 aa16.84■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EPAS1Q99814 870 aa16.84■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZSWIM1Q9BR11 485 aa16.84■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TNKS2Q9H2K2 1166 aa16.84■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM204AQ9H8W3 233 aa16.84■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SIRPGQ9P1W8 387 aa16.84■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PCDHA7Q9UN72 937 aa16.84■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa16.84■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa16.84■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WASF2Q9Y6W5 498 aa16.84■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NBASA2RRP1 2371 aa16.84■□□□□ 0.29
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CETN3O15182 167 aa16.83■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SNAP91O60641 907 aa16.83■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RHOBTB3O94955 611 aa16.83■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RHOCP08134 193 aa16.83■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CTSEP14091 401 aa16.83■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ETV5P41161 510 aa16.83■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CDK17Q00537 523 aa16.83■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZCWPW2Q504Y3 356 aa16.83■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GKN2Q86XP6 184 aa16.83■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPATA20Q8TB22 786 aa16.83■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STK32AQ8WU08 396 aa16.83■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CENPTQ96BT3 561 aa16.83■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARHGEF26Q96DR7 871 aa16.83■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PSMB7Q99436 277 aa16.83■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HEPHQ9BQS7 1158 aa16.83■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa16.83■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 THAP9Q9H5L6 903 aa16.83■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DDIT4Q9NX09 232 aa16.83■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 USP25Q9UHP3 1055 aa16.83■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 APPL1Q9UKG1 709 aa16.83■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPR34Q9UPC5 381 aa16.83■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PNLIPP16233 465 aa16.82■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPD2P43304 727 aa16.82■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CD97P48960 835 aa16.82■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LRMPQ12912 555 aa16.82■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C5orf22Q49AR2 442 aa16.82■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EDEM3Q9BZQ6 932 aa16.82■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CEP44Q9C0F1 390 aa16.82■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLAAQ9Y263 795 aa16.82■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCN8AQ9UQD0 1980 aa16.82■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GLB1P16278 677 aa16.81■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IRAK1P51617 712 aa16.81■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HK3P52790 923 aa16.81■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC20A2Q08357 652 aa16.81■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RETSATQ6NUM9 610 aa16.81■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LINGO4Q6UY18 593 aa16.81■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IL22RA1Q8N6P7 574 aa16.81■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NKD1Q969G9 470 aa16.81■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MIB2Q96AX9 1013 aa16.81■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CDH19Q9H159 772 aa16.81■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa16.81■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HS3ST4Q9Y661 456 aa16.81■□□□□ 0.28
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RNF215Q9Y6U7 377 aa16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms