RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 MS4A2Q01362 244 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 PRKAA1Q13131 559 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF423Q2M1K9 1284 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 CCNYL1Q8N7R7 359 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 SPATA22Q8NHS9 363 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 OMDQ99983 421 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 RHOJQ9H4E5 214 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 CRTAC1Q9NQ79 661 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 XPR1Q9UBH6 696 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 OR12D3Q9UGF7 316 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1B0GVG6 124 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM233B4DJY2 109 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 SEPT4O43236 478 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 PMLP29590 882 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 GALNT2Q10471 571 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 SCAPQ12770 1279 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 CTBP1Q13363 440 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 BIRC2Q13490 618 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 CEACAM7Q14002 265 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 CNGA3Q16281 694 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 DEFB115Q30KQ5 88 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 PIGGQ5H8A4 983 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 DENND6AQ8IWF6 608 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 LSMEM2Q8N112 164 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 PAAF1Q9BRP4 392 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 KATNAL1Q9BW62 490 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 COLEC11Q9BWP8 271 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM30AQ9NV96 361 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 RAD54BQ9Y620 910 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 MTSS1O43312 755 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 ADAMTS4O75173 837 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 DDHD2O94830 711 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 DPP6P42658 865 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 GJA9P57773 515 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 POU6F1Q14863 301 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 ARL13BQ3SXY8 428 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 RDH11Q8TC12 318 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 HASPINQ8TF76 798 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 SMOQ99835 787 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 TKTL2Q9H0I9 626 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 PCDHGB4Q9UN71 923 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 DLX3O60479 287 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 LRIG2O94898 1065 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 CD52P31358 61 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 MPP1Q00013 466 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC12A1Q13621 1099 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 STYXQ8WUJ0 223 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 NCSTNQ92542 709 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 GAD1Q99259 594 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 WDCPQ9H6R7 721 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 WDR41Q9HAD4 459 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 AIF1P55008 147 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 ART3Q13508 389 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 PRPSAP1Q14558 356 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 CNTD1Q8N815 330 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 NAT14Q8WUY8 206 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 NXNL1Q96CM4 212 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 SGF29Q96ES7 293 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 EPAS1Q99814 870 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 FTHL17Q9BXU8 183 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAJA2O60884 412 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 VAPBO95292 243 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 HCAR3P49019 387 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 CSRP3P50461 194 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 XKR4Q5GH76 650 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 SPNS2Q8IVW8 549 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 CEP97Q8IW35 865 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM156AQ8NDB6 213 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 NPAS2Q99743 824 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 UBAP1Q9NZ09 502 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 CLIC5Q9NZA1 410 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 FIS1Q9Y3D6 152 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 MYBPHLA2RUH7 354 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 PTGESO14684 152 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 HADHAP40939 763 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 CDC42EP1Q00587 391 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 NOGQ13253 232 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 ADGRE1Q14246 886 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 PGAM4Q8N0Y7 254 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
SH3BP1-202ENST00000417536 ZMIZ2Q8NF64 920 aa18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms