RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MATN3O15232 486 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LRP3O75074 770 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LEFTY1O75610 366 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EPN2O95208 641 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PEX11BO96011 259 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CTSLP07711 333 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ITGB7P26010 798 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DRD3P35462 400 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MARCKSL1P49006 195 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCDC173Q0VFZ6 552 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PDK1Q15118 436 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARSIQ5FYB1 569 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RALGPS1Q5JS13 557 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SYCP2LQ5T4T6 812 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MARC1Q5VT66 337 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCDC50Q8IVM0 306 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TP53INP2Q8IXH6 220 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AADATQ8N5Z0 425 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HCAR2Q8TDS4 363 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAML1Q92585 1016 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PHOX2BQ99453 314 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HDAC8Q9BY41 377 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SARDHQ9UL12 918 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LRRC72A6NJI9 287 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRIT1O00522 736 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZSCAN12O43309 604 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GFRA3O60609 400 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CST8O60676 142 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SEMA4FO95754 770 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AP1S1P61966 158 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF235Q14590 738 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF805Q5CZA5 627 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WDR45BQ5MNZ6 344 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LYSMD4Q5XG99 296 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BBS12Q6ZW61 710 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ASCL5Q7RTU5 278 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RABEPKQ7Z6M1 372 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TEX26Q8N6G2 289 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FRMD1Q8N878 549 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRIM58Q8NG06 486 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR2T34Q8NGX1 318 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAB7BQ96AH8 199 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HES6Q96HZ4 224 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OLFM3Q96PB7 478 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MGME1Q9BQP7 344 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GPR174Q9BXC1 333 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NEUROG2Q9H2A3 272 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CD93Q9NPY3 652 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LZTFL1Q9NQ48 299 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NCDNQ9UBB6 729 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DKK3Q9UBP4 350 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HEY1Q9Y5J3 304 aa15.51■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa15.5■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 METTL12A8MUP2 240 aa15.5■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FTCDO95954 541 aa15.5■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CES1P23141 567 aa15.5■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ACSL1P33121 698 aa15.5■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MMP13P45452 471 aa15.5■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SUOXP51687 545 aa15.5■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NEK3P51956 506 aa15.5■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADPRHP54922 357 aa15.5■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC10A7Q0GE19 358 aa15.5■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AGBL4Q5VU57 503 aa15.5■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NEK5Q6P3R8 708 aa15.5■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GDPD4Q6W3E5 623 aa15.5■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CYP2U1Q7Z449 544 aa15.5■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM124AQ86V42 546 aa15.5■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZSCAN30Q86W11 494 aa15.5■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCDC13Q8IYE1 715 aa15.5■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEFF1Q8IYR6 380 aa15.5■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NETO2Q8NC67 525 aa15.5■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCNYQ8ND76 341 aa15.5■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ALG3Q92685 438 aa15.5■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 P3H4Q92791 437 aa15.5■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PREBQ9HCU5 417 aa15.5■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SERGEFQ9UGK8 458 aa15.5■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1W2PQ67 120 aa15.49■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C10orf142B7Z368 130 aa15.49■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AP1G1O43747 822 aa15.49■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TJP3O95049 919 aa15.49■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRT10P13645 584 aa15.49■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NUDT1P36639 197 aa15.49■□□□□ 0.07
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms