RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398417.6

SMAD4-202, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SMAD4, Length 8,495 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-202ENST00000398417 PKN3Q6P5Z2 889 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 CCDC28BQ9BUN5 200 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 SPON1Q9HCB6 807 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 THEGQ9P2T0 379 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 CROTQ9UKG9 612 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 LRRC42Q9Y546 428 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 RGPD2P0DJD1 1756 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 A6NHS1 94 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 DDHD2O94830 711 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 PIRTP0C851 137 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 ODC1P11926 461 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 RAP1GDS1P52306 607 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 AQP4P55087 323 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 UGP2Q16851 508 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 PITRM1Q5JRX3 1037 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 OLFML2BQ68BL8 750 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 KLC3Q6P597 504 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 C16orf59Q7L2K0 433 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 EFHBQ8N7U6 833 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 ACMSDQ8TDX5 336 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 TRPC4APQ8TEL6 797 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 TMEM40Q8WWA1 233 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 ARNTL2Q8WYA1 636 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 TLE6Q9H808 572 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 CRTAC1Q9NQ79 661 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 FBXW11Q9UKB1 542 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 LRFN2Q9ULH4 789 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 GSTA4O15217 222 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 ZBTB14O43829 449 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 DNAJA2O60884 412 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 LRIG2O94898 1065 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 UQCRBP14927 111 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 CCR1P32246 355 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 CDK7P50613 346 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 HUNKP57058 714 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 DSC2Q02487 901 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 ANO4Q32M45 955 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 TEX44Q53QW1 395 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 C10orf120Q5SQS8 335 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 KIAA0319Q5VV43 1072 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 CXorf38Q8TB03 319 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 NPY6RQ99463 290 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 NFKBIZQ9BYH8 718 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 SLC38A7Q9NVC3 462 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 KIF17Q9P2E2 1029 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 A0A1W2PQH9 124 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 F8W8V4 182 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 HDAC3O15379 428 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 ATP6AP2O75787 350 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 ME2P23368 584 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 CLCNKBP51801 687 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 WNT3AP56704 352 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 GNASQ5JWF2 1037 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 NEPROQ6NW34 567 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 ZYG11AQ6WRX3 759 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 BBS5Q8N3I7 341 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 EME1Q96AY2 570 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 FAXDC2Q96IV6 333 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 CDC6Q99741 560 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 ROGDIQ9GZN7 287 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 PIF1Q9H611 641 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 SPC25Q9HBM1 224 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 FBXO5Q9UKT4 447 aa4.99□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 OR51F1A6NGY5 319 aa4.98□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 STRNO43815 780 aa4.98□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 B3GAT3O94766 335 aa4.98□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 ACTR3P61158 418 aa4.98□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 NFYCQ13952 458 aa4.98□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 CEACAM7Q14002 265 aa4.98□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 CCNIQ14094 377 aa4.98□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 TIGD5Q53EQ6 642 aa4.98□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
SMAD4-202ENST00000398417 FRMD7Q6ZUT3 714 aa4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms