RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384160.1

RNU6-1008P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1008, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1008P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DCAF4Q8WV16 495 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KCTD13Q8WZ19 329 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PTERQ96BW5 349 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RMI2Q96E14 147 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HSPB9Q9BQS6 159 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LAT2Q9GZY6 243 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C10orf88Q9H8K7 445 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF224Q9NZL3 707 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 APEX2Q9UBZ4 518 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LRWD1Q9UFC0 647 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PHTF1Q9UMS5 762 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa-1.75□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HYDINQ4G0P3 5121 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HSPG2P98160 4391 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GLTPD2A6NH11 291 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ASB14A6NK59 587 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NPIPB5A8MRT5 1133 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NPIPB4C9JG80 1138 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TLR3O15455 904 aaKnown RBP-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IDH3BO43837 385 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LYPD3O95274 346 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ODC1P11926 461 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GPX3P22352 226 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GNLYP22749 145 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CIITAP33076 1130 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 EFNA5P52803 228 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TAS2R38P59533 333 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CLCQ05315 142 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MGAT5Q09328 741 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PAK1Q13153 545 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CDKN3Q16667 212 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PTPN21Q16825 1174 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 Q1RN00 199 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NSMFQ6X4W1 530 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF841Q6ZN19 808 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ANKS3Q6ZW76 656 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NOSTRINQ8IVI9 506 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RFWD2Q8NHY2 731 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FBXO27Q8NI29 283 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KCNG4Q8TDN1 519 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PPP1R14AQ96A00 147 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SCRN2Q96FV2 425 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CALML4Q96GE6 196 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TXNDC15Q96J42 360 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TNIP3Q96KP6 325 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LINC00477Q96M19 166 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FOPNLQ96NB1 174 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PRR25Q96S07 402 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SMC6Q96SB8 1091 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KRT12Q99456 494 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IKZF5Q9H5V7 419 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 BCO1Q9HAY6 547 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ADPRHL2Q9NX46 363 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PRKAG3Q9UGI9 489 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LAMP3Q9UQV4 416 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GTF3C1Q12789 2109 aa-1.76□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 UBR4Q5T4S7 5183 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 BDP1A6H8Y1 2624 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 A0A0G2JPF8 293 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GSAPA4D1B5 854 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CCDC85CA6NKD9 419 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RHODO00212 210 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CES2O00748 559 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DLGAP1O14490 977 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RRHO14718 337 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SYNGR3O43761 229 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MED6O75586 246 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KRT14P02533 472 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LINC00271P0C7V0 271 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CHRNB2P17787 502 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MSR1P21757 451 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HTR1FP30939 366 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MCM4P33991 863 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CPT1AP50416 773 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PLCB2Q00722 1185 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 APOBRQ0VD83 1088 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CLUL1Q15846 466 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 WDR38Q5JTN6 314 aa-1.77□□□□□ -2.69
RNU6-1008P-201ENST00000384160 VPS53Q5VIR6 699 aa-1.77□□□□□ -2.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms