RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384143.1

RNU6-398P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 398, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-398P, Length 109 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-398P-201ENST00000384143 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 TCEA3O75764 348 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 ASLP04424 464 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 F13BP05160 661 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 RNF224P0DH78 156 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 SFTPCP11686 197 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 UGT1A5P35504 534 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 NUDT1P36639 197 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 CASRP41180 1078 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 INHBCP55103 352 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 TAS2R38P59533 333 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZNF445P59923 1031 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 DLG4P78352 724 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 INCA1Q0VD86 236 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 CNTN1Q12860 1018 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 FZD2Q14332 565 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 DEFB133Q30KQ1 61 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 PITRM1Q5JRX3 1037 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 RAB41Q5JT25 222 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 TPRG1LQ5T0D9 272 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 MPP7Q5T2T1 576 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 RRAGBQ5VZM2 374 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 OR6B2Q6IFH4 312 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 GCNT7Q6ZNI0 430 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 C14orf80Q86SX3 495 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 PIGZQ86VD9 579 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 JAMLQ86YT9 394 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 APCDD1Q8J025 514 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 ARHGAP18Q8N392 663 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 KDM1BQ8NB78 822 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 FIBINQ8TAL6 211 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 PARD3BQ8TEW8 1205 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 PMEPA1Q969W9 287 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 DUSP23Q9BVJ7 150 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 NT5C1AQ9BXI3 368 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 DUSP16Q9BY84 665 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 PANK2Q9BZ23 570 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 ULBP1Q9BZM6 244 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 GPR27Q9NS67 375 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 DNAJC28Q9NX36 388 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 FOXJ2Q9P0K8 574 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 ACSL6Q9UKU0 697 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 A0A1W2PQU0 124 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 NEMP2A6NFY4 417 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 YJEFN3A6XGL0 299 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 E7ENQ6 273 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 RNF103O00237 685 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 AGRPO00253 132 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 EREGO14944 169 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 SLC7A4O43246 635 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 EXOC3O60645 756 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 LATS1O95835 1130 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 BMP15O95972 392 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZBED1O96006 694 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 ASS1P00966 412 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 IGLV3-27P01718 113 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 HLA-DRAP01903 254 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 CSF2P04141 144 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 PRNPP04156 253 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 SLFN14P0C7P3 912 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 LIPCP11150 499 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 P4HA1P13674 534 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 FOSL1P15407 271 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 CD58P19256 250 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 ITIH1P19827 911 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 STAT6P42226 847 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 TKTL1P51854 596 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 POLE2P56282 527 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 ECT2LQ008S8 904 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 KCNAB2Q13303 367 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 CDH18Q13634 790 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 MORC3Q14149 939 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 SPIDRQ14159 915 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 FGL2Q14314 439 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 NCAPHQ15003 741 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 NR0B2Q15466 257 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZNF284Q2VY69 593 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-398P-201ENST00000384143 ZACNQ401N2 412 aa4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms