RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365490.1

RN7SKP249-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 249, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP249, Length 355 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP249-201ENST00000365490 GUCY2DQ02846 1103 aa9.9□□□□□ -0.82
RN7SKP249-201ENST00000365490 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP9.9□□□□□ -0.82
RN7SKP249-201ENST00000365490 CCINQ13939 588 aa9.9□□□□□ -0.82
RN7SKP249-201ENST00000365490 ZNF234Q14588 700 aa9.9□□□□□ -0.82
RN7SKP249-201ENST00000365490 KCNJ11Q14654 390 aa9.9□□□□□ -0.82
RN7SKP249-201ENST00000365490 PON2Q15165 354 aa9.9□□□□□ -0.82
RN7SKP249-201ENST00000365490 FBXO43Q4G163 708 aa9.9□□□□□ -0.82
RN7SKP249-201ENST00000365490 CARD16Q5EG05 197 aa9.9□□□□□ -0.82
RN7SKP249-201ENST00000365490 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
RN7SKP249-201ENST00000365490 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
RN7SKP249-201ENST00000365490 C22orf39Q6P5X5 142 aa9.9□□□□□ -0.82
RN7SKP249-201ENST00000365490 NCEH1Q6PIU2 408 aa9.9□□□□□ -0.82
RN7SKP249-201ENST00000365490 ZNF852Q6ZMS4 543 aa9.9□□□□□ -0.82
RN7SKP249-201ENST00000365490 TPRG1Q6ZUI0 275 aa9.9□□□□□ -0.82
RN7SKP249-201ENST00000365490 IFT20Q8IY31 132 aa9.9□□□□□ -0.82
RN7SKP249-201ENST00000365490 GJD3Q8N144 294 aa9.9□□□□□ -0.82
RN7SKP249-201ENST00000365490 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
RN7SKP249-201ENST00000365490 NAT8LQ8N9F0 302 aa9.9□□□□□ -0.82
RN7SKP249-201ENST00000365490 OR2AP1Q8NGE2 309 aa9.9□□□□□ -0.82
RN7SKP249-201ENST00000365490 OR2A12Q8NGT7 310 aa9.9□□□□□ -0.82
RN7SKP249-201ENST00000365490 FAM3CQ92520 227 aa9.9□□□□□ -0.82
RN7SKP249-201ENST00000365490 CPT1BQ92523 772 aa9.9□□□□□ -0.82
RN7SKP249-201ENST00000365490 PTPRN2Q92932 1015 aa9.9□□□□□ -0.82
RN7SKP249-201ENST00000365490 ART4Q93070 314 aa9.9□□□□□ -0.82
RN7SKP249-201ENST00000365490 SNF8Q96H20 258 aa9.9□□□□□ -0.82
RN7SKP249-201ENST00000365490 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
RN7SKP249-201ENST00000365490 SEMA3CQ99985 751 aa9.9□□□□□ -0.82
RN7SKP249-201ENST00000365490 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
RN7SKP249-201ENST00000365490 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
RN7SKP249-201ENST00000365490 FAM129AQ9BZQ8 928 aa9.9□□□□□ -0.82
RN7SKP249-201ENST00000365490 NOD2Q9HC29 1040 aa9.9□□□□□ -0.82
RN7SKP249-201ENST00000365490 EPB41L5Q9HCM4 733 aa9.9□□□□□ -0.82
RN7SKP249-201ENST00000365490 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
RN7SKP249-201ENST00000365490 VPS45Q9NRW7 570 aa9.9□□□□□ -0.82
RN7SKP249-201ENST00000365490 ASIC3Q9UHC3 531 aa9.9□□□□□ -0.82
RN7SKP249-201ENST00000365490 RSPH14Q9UHP6 348 aa9.9□□□□□ -0.82
RN7SKP249-201ENST00000365490 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
RN7SKP249-201ENST00000365490 SNX24Q9Y343 169 aa9.9□□□□□ -0.82
RN7SKP249-201ENST00000365490 KRBA1A5PL33 1030 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 ANTXRLA6NF34 631 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 TTC34A8MYJ7 566 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 NDC80O14777 642 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 INSIG1O15503 277 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 GJB3O75712 270 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 POP4O95707 220 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 AP2A1O95782 977 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 TUBBP07437 444 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 TPSB2P20231 275 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 ADRA1AP35348 466 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 MAPK8P45983 427 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 RHOAP61586 193 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 ST8SIA6P61647 398 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 AP1S1P61966 158 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 DSC2Q02487 901 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 CAV1Q03135 178 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 MPP3Q13368 585 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 CUL1Q13616 776 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 PRPSAP1Q14558 356 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 MORF4L2Q15014 288 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 TPSAB1Q15661 275 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 MYLK3Q32MK0 819 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 C9orf64Q5T6V5 341 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 EMC10Q5UCC4 262 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 WDR93Q6P2C0 686 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 KDELC1Q6UW63 502 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 ZDHHC24Q6UX98 284 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 RANBP10Q6VN20 620 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 SRLQ86TD4 932 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 HOOK3Q86VS8 718 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 PPIL6Q8IXY8 311 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 MCUQ8NE86 351 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 SPATA22Q8NHS9 363 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 SPOCK2Q92563 424 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 SHDQ96IW2 340 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 NELL2Q99435 816 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 GABRG3Q99928 467 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 HINFPQ9BQA5 517 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 EPC1Q9H2F5 836 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 ARHGEF3Q9NR81 526 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 FAM114A2Q9NRY5 505 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 FAM153AQ9UHL3 310 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 RAB21Q9UL25 225 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 SLC8A2Q9UPR5 921 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 STON1Q9Y6Q2 735 aa9.89□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa9.88□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa9.88□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa9.88□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 ESYT3A0FGR9 886 aa9.88□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
RN7SKP249-201ENST00000365490 FZD6O60353 706 aa9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms