RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362858.1

RNU6-655P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 655, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-655P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-655P-201ENST00000362858 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF304Q9HCX3 659 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 PCDHGB4Q9UN71 923 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 A4GNTQ9UNA3 340 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMEM5Q9Y2B1 443 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 MYRFQ9Y2G1 1151 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 SNX8Q9Y5X2 465 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 AOX1Q06278 1338 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 PASKQ96RG2 1323 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 MST1RQ04912 1400 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 TTC36A6NLP5 189 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 LRRC53A6NM62 1247 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 FOXO6A8MYZ6 492 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 MYO1GB0I1T2 1018 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 SNAP23O00161 211 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 EBAG9O00559 213 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 NFATC1O95644 943 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 TFP02787 698 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 LCKP06239 509 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 HOXB5P09067 269 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 NR2F1P10589 423 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 IRF1P10914 325 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC2A4P14672 509 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 PTPN2P17706 415 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 IL11P20809 199 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 TACR2P21452 398 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 KLRC2P26717 231 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 YWHAQP27348 245 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 CDAP32320 146 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 RYKP34925 604 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 PTGER1P34995 402 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 DPP6P42658 865 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 CENPAP49450 140 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 CLCNKBP51801 687 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC12A2P55011 1212 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 CLDN2P57739 230 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 SNX16P57768 344 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 NIPAL4Q0D2K0 466 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 FGFBP1Q14512 234 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 IRF3Q14653 427 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 CRYMQ14894 314 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 ALG11Q2TAA5 492 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 CFAP58Q5T655 872 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 FCRLBQ6BAA4 426 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 FBXO42Q6P3S6 717 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMEM154Q6P9G4 183 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 SARM1Q6SZW1 724 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 OLFML1Q6UWY5 402 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 CYB5R4Q7L1T6 521 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 KRT74Q7RTS7 529 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 ADGRF2Q8IZF7 708 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 Q8N1X5 172 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 BCAS4Q8TDM0 211 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 CALML4Q96GE6 196 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 FEM1CQ96JP0 617 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 C1orf74Q96LT6 269 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 CMTM3Q96MX0 182 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLF1Q9BQI6 1058 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 H2AFJQ9BTM1 129 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 IKZF4Q9H2S9 585 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 KAT14Q9H8E8 782 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 RPS6KA6Q9UK32 745 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-655P-201ENST00000362858 A0A1W2PQ09 198 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 LINC01548A6NM66 108 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 CDRT15L2A8MXV6 281 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 USP17L23D6RBM5 183 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 RHODO00212 210 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 RNMTO43148 476 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC25A17O43808 307 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 PROP1O75360 226 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-655P-201ENST00000362858 BEST1O76090 585 aa2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.7 ms