RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 TBC1D3HP0C7X1 549 aa27.4■■□□□ 1.98
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TPGS1-201ENST00000359315 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa27.4■■□□□ 1.98
TPGS1-201ENST00000359315 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa27.4■■□□□ 1.98
TPGS1-201ENST00000359315 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa27.4■■□□□ 1.98
TPGS1-201ENST00000359315 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
TPGS1-201ENST00000359315 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
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TPGS1-201ENST00000359315 SP110Q9HB58 689 aa27.4■■□□□ 1.98
TPGS1-201ENST00000359315 TM9SF3Q9HD45 589 aa27.4■■□□□ 1.98
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TPGS1-201ENST00000359315 C4orf47A7E2U8 309 aa27.39■■□□□ 1.98
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TPGS1-201ENST00000359315 UGT2B4P06133 528 aa27.39■■□□□ 1.98
TPGS1-201ENST00000359315 KRT7P08729 469 aa27.39■■□□□ 1.98
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TPGS1-201ENST00000359315 ITGB7P26010 798 aa27.39■■□□□ 1.98
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TPGS1-201ENST00000359315 ARHGAP25P42331 645 aa27.39■■□□□ 1.98
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TPGS1-201ENST00000359315 SPA17Q15506 151 aa27.39■■□□□ 1.98
TPGS1-201ENST00000359315 TMTC1Q8IUR5 882 aa27.39■■□□□ 1.98
TPGS1-201ENST00000359315 LZTR1Q8N653 840 aa27.39■■□□□ 1.98
TPGS1-201ENST00000359315 ACRBPQ8NEB7 543 aa27.39■■□□□ 1.98
TPGS1-201ENST00000359315 SLC6A18Q96N87 628 aa27.39■■□□□ 1.98
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TPGS1-201ENST00000359315 A0A1W2PPC4 97 aa27.38■■□□□ 1.97
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TPGS1-201ENST00000359315 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 GJB3O75712 270 aa27.38■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 MAP3K6O95382 1288 aa27.38■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 IGSF6O95976 241 aa27.38■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 COMTP21964 271 aa27.38■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 ABL2P42684 1182 aa27.38■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 GRIK2Q13002 908 aa27.38■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 RABEPKQ7Z6M1 372 aa27.38■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF670Q9BS34 389 aa27.38■■□□□ 1.97
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TPGS1-201ENST00000359315 CEP192Q8TEP8 1941 aa27.37■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 PCDH15Q96QU1 1955 aa27.37■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 DCDC2BA2VCK2 349 aa27.37■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 PIGNO95427 931 aa27.37■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 POP4O95707 220 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
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TPGS1-201ENST00000359315 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa27.37■■□□□ 1.97
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TPGS1-201ENST00000359315 PPP1R16AQ96I34 528 aa27.37■■□□□ 1.97
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TPGS1-201ENST00000359315 TMEM9BQ9NQ34 198 aa27.37■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 CEP250Q9BV73 2442 aa27.36■■□□□ 1.97
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TPGS1-201ENST00000359315 ARHGAP33O14559 1287 aa27.36■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 SPINT1O43278 529 aa27.36■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 LATO43561 262 aa27.36■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 MAFKO60675 156 aa27.36■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 PALMO75781 387 aa27.36■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 TNNT1P13805 278 aa27.36■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 ADRB3P13945 408 aa27.36■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 KDELR1P24390 212 aa27.36■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 HADHBP55084 474 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 SLC10A7Q0GE19 358 aa27.36■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP27.36■■□□□ 1.97
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TPGS1-201ENST00000359315 NSMCE3Q96MG7 304 aa27.36■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
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TPGS1-201ENST00000359315 KDM4CQ9H3R0 1056 aa27.36■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 IMPACTQ9P2X3 320 aa27.36■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 GGT7Q9UJ14 662 aa27.36■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 ITM2BQ9Y287 266 aa27.36■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 LRRD1A4D1F6 860 aa27.35■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 C16orf96A6NNT2 1141 aa27.35■■□□□ 1.97
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TPGS1-201ENST00000359315 ZNF805Q5CZA5 627 aa27.35■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 LRRC73Q5JTD7 316 aa27.35■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 GDPD4Q6W3E5 623 aa27.35■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 TRIM69Q86WT6 500 aa27.35■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 MINDY1Q8N5J2 469 aa27.35■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 LRRN4Q8WUT4 740 aa27.35■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 KLK6Q92876 244 aa27.35■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 LRIG1Q96JA1 1093 aa27.35■■□□□ 1.97
TPGS1-201ENST00000359315 RTKNQ9BST9 563 aa27.35■■□□□ 1.97
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