RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 CDKN3Q16667 212 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 HSP90B2PQ58FF3 399 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 LGSNQ5TDP6 509 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SLC2A11Q9BYW1 496 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 FAM117AQ9C073 453 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CLPBQ9H078 707 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 WDR26Q9H7D7 661 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 NMUR1Q9HB89 426 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 BPIFA1Q9NP55 256 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 IL36AQ9UHA7 158 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CD84Q9UIB8 345 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 LCMT1Q9UIC8 334 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 APPL1Q9UKG1 709 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 TLK1Q9UKI8 766 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 HEATR9A2RTY3 570 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 TTC34A8MYJ7 566 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 GOLGA8MH3BSY2 632 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 PLK4O00444 970 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 NPC1O15118 1278 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 PI15O43692 258 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 GLP2RO95838 553 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ITGAXP20702 1163 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 PTPN3P26045 913 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 GRK3P35626 688 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 GPS2Q13227 327 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 MTM1Q13496 603 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 FAM208BQ5VWN6 2430 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 RHBDF2Q6PJF5 856 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 RAD9BQ6WBX8 426 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 TAOK1Q7L7X3 1001 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC91Q7Z6B0 441 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 TET1Q8NFU7 2136 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 GRK7Q8WTQ7 553 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CLEC4CQ8WTT0 213 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 OVCA2Q8WZ82 227 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF516Q92618 1163 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CLIP3Q96DZ5 547 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 BTBD6Q96KE9 485 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 FAM118BQ9BPY3 351 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 RNF38Q9H0F5 515 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 MMP17Q9ULZ9 603 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CHKBQ9Y259 395 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 TULP2O00295 520 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 NOL4O94818 638 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ABLIM3O94929 683 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CRTAMO95727 393 aa4.5□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SLC12A1Q13621 1099 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 C3orf38Q5JPI3 329 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SYPL2Q5VXT5 272 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ALKBH2Q6NS38 261 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 PCGF5Q86SE9 256 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 PIM3Q86V86 326 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SYTL1Q8IYJ3 562 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 GPR65Q8IYL9 337 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC170Q8IYT3 715 aa4.5□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 SLC6A17Q9H1V8 727 aa4.5□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 RAB6BQ9NRW1 208 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 PCMTD2Q9NV79 361 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 UVRAGQ9P2Y5 699 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 GPR34Q9UPC5 381 aa4.5□□□□□ -1.69
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PTPRC-201ENST00000348564 CCDC66A2RUB6 948 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 USP27XA6NNY8 438 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 C9J4A7 227 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ACP5P13686 325 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 RHOQP17081 205 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 ATF6P18850 670 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 MIPP30301 263 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 WNT7BP56706 349 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 NFATC2Q13469 925 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 TOMM20Q15388 145 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRC-201ENST00000348564 SLC25A52Q3SY17 297 aa4.49□□□□□ -1.69
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