RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 CD93Q9NPY3 652 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 SARDHQ9UL12 918 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 PPM1HQ9ULR3 514 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 TTLL3Q9Y4R7 772 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 WASF2Q9Y6W5 498 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 THADAQ6YHU6 1953 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 POP4O95707 220 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 ADH1BP00325 375 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 MAXP61244 160 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 ZBTB16Q05516 673 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 FAM46CQ5VWP2 391 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 PGBD5Q8N414 524 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 TEX26Q8N6G2 289 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 GANCQ8TET4 914 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 KCNH6Q9H252 994 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 CYP8B1Q9UNU6 501 aa22.66■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 HACD1B0YJ81 288 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 INSIG1O15503 277 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF217O75362 1048 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 JCHAINP01591 159 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 SCNN1BP51168 640 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 TPMTP51580 245 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 METAP1P53582 386 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 ITKQ08881 620 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 XRCC4Q13426 336 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 FAM182AQ5T1J6 154 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 FAM124AQ86V42 546 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 TMIEQ8NEW7 156 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 CEP41Q9BYV8 373 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 ITM2CQ9NQX7 267 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 SCML1Q9UN30 329 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa22.65■■□□□ 1.22
HOXD4-201ENST00000306324 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 RNF103O00237 685 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 GJB3O75712 270 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 FGGP02679 453 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 RBP3P10745 1247 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 C5AR1P21730 350 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 PTPN5P54829 565 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 ZBTB17Q13105 803 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 SLC45A4Q5BKX6 768 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 SRLQ86TD4 932 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP22.64■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 FRMD1Q8N878 549 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 ZBTB44Q8NCP5 570 aa22.64■■□□□ 1.21
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HOXD4-201ENST00000306324 OMDQ99983 421 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 MGME1Q9BQP7 344 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 C10orf88Q9H8K7 445 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 HAUS2Q9NVX0 235 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 FBXL12Q9NXK8 326 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 R4GN57 208 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 SDK1Q7Z5N4 2213 aa22.64■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 A0A1W2PP55 124 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 RPP40O75818 363 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 UGT2B4P06133 528 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 P2RY2P41231 377 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 CSNK1DP48730 415 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 HDDC3Q8N4P3 179 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 AADATQ8N5Z0 425 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 LRIG1Q96JA1 1093 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 OSBPL9Q96SU4 736 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 IL12RB2Q99665 862 aa22.63■■□□□ 1.21
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HOXD4-201ENST00000306324 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 SCUBE2Q9NQ36 999 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 DYRK4Q9NR20 520 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 SNX12Q9UMY4 172 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 PLK4O00444 970 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 PIGNO95427 931 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 HLA-DQB2P05538 268 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 C7P10643 843 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 RBL1P28749 1068 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 LONRF2Q1L5Z9 754 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 MAP7D1Q3KQU3 841 aa22.62■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
HOXD4-201ENST00000306324 GAB3Q8WWW8 586 aa22.62■■□□□ 1.21
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