RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289577.9

TMED4-201, Transcript of transmembrane p24 trafficking protein 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMED4, Length 2,203 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED4-201ENST00000289577 HMGCLL1Q8TB92 370 aa20.62■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 VAT1Q99536 393 aa20.62■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa20.62■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 ANLNQ9NQW6 1124 aa20.62■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa20.62■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 SBF1O95248 1867 aa20.61■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa20.61■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 I6L893 689 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 DNAJB2P25686 324 aa20.61■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 RAB10P61026 200 aa20.61■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 GALNT2Q10471 571 aa20.61■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 STX5Q13190 355 aa20.61■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 NXNL1Q96CM4 212 aa20.61■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 PCDHAC1Q9H158 963 aa20.61■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 OLAHQ9NV23 265 aa20.61■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 MRGBPQ9NV56 204 aa20.61■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 IRF6O14896 467 aa20.61■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 PFDN1O60925 122 aa20.61■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 ADARP55265 1226 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 DNAJB13P59910 316 aa20.61■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 TPI1P60174 286 aa20.61■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 TUBA4AP68366 448 aa20.61■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 SULT2A1Q06520 285 aa20.61■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 DGKDQ16760 1214 aa20.61■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 CEP97Q8IW35 865 aa20.61■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 MFSD6LQ8IWD5 586 aa20.61■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa20.61■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 TRIML2Q8N7C3 387 aa20.61■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 CCNYL1Q8N7R7 359 aa20.61■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 KCTD13Q8WZ19 329 aa20.61■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 DPF3Q92784 378 aa20.61■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 TEKT5Q96M29 485 aa20.61■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 FTHL17Q9BXU8 183 aa20.61■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa20.61■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 SLC7A1P30825 629 aa20.6■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 NDUFV1P49821 464 aa20.6■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 LAMC2Q13753 1193 aa20.6■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 KCTD2Q14681 263 aa20.6■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 UGP2Q16851 508 aa20.6■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa20.6■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 GADL1Q6ZQY3 521 aa20.6■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 HFE2Q6ZVN8 426 aa20.6■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 SPPL2BQ8TCT7 592 aa20.6■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 TRPM4Q8TD43 1214 aa20.6■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 LPGAT1Q92604 370 aa20.6■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 TMIGD2Q96BF3 282 aa20.6■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 TXNRD2Q9NNW7 524 aa20.6■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 PNPLA3Q9NST1 481 aa20.6■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa20.6■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 CD300AQ9UGN4 299 aa20.6■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 MYRFQ9Y2G1 1151 aa20.6■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 FBP2O00757 339 aa20.59■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 FYNP06241 537 aa20.59■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 MAPRE2Q15555 327 aa20.59■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa20.59■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 SLC27A1Q6PCB7 646 aa20.59■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 CNSTQ6PJW8 725 aa20.59■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 RIN3Q8TB24 985 aa20.59■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 BIRC8Q96P09 236 aa20.59■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 SLC29A1Q99808 456 aa20.59■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 HACD3Q9P035 362 aa20.59■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 HEATR9A2RTY3 570 aa20.59■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 PRORSD1PA6NEY8 169 aa20.59■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 FZD9O00144 591 aa20.59■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 BEST1O76090 585 aa20.59■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 CSPG5O95196 566 aa20.59■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 SQLEQ14534 574 aa20.59■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 ZNF460Q14592 562 aa20.59■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 REP15Q6BDI9 236 aa20.59■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 PKN3Q6P5Z2 889 aa20.59■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 HERC6Q8IVU3 1022 aa20.59■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa20.59■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 APPL2Q8NEU8 664 aa20.59■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 HM13Q8TCT9 377 aa20.59■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 TRPC4APQ8TEL6 797 aa20.59■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 TNIP3Q96KP6 325 aa20.59■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 OMDQ99983 421 aa20.59■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 TMEM79Q9BSE2 394 aa20.59■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 TRPV6Q9H1D0 765 aa20.59■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 OSBPL2Q9H1P3 480 aa20.59■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa20.59■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 UNCXA6NJT0 531 aa20.58■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 CACNG3O60359 315 aa20.58■□□□□ 0.89
TMED4-201ENST00000289577 STMN1P16949 149 aa20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms