RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 SCML4Q8N228 414 aa28.36■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 NCSTNQ92542 709 aa28.36■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 TRIM62Q9BVG3 475 aa28.36■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 PCSK1P29120 753 aa28.35■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 AVPR1AP37288 418 aa28.35■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 CCR10P46092 362 aa28.35■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 CHN2P52757 468 aa28.35■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 THOP1P52888 689 aa28.35■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 FOLH1Q04609 750 aa28.35■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 PPP2R5DQ14738 602 aa28.35■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 DLG3Q92796 817 aa28.35■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 RCN3Q96D15 328 aa28.35■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 PPP1R36Q96LQ0 422 aa28.35■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 GPR78Q96P69 363 aa28.35■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 EFCAB1Q9HAE3 211 aa28.35■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa28.34■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 TRPC5OSA6NMA1 111 aa28.34■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 DENRO43583 198 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 ATPAF2Q8N5M1 289 aa28.34■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 RNF34Q969K3 372 aa28.34■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 MOCOSQ96EN8 888 aa28.34■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 CATSPER2Q96P56 530 aa28.34■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 Q9H521 79 aa28.34■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 MRGBPQ9NV56 204 aa28.34■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa28.34■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 A0A087X1B8 175 aa28.34■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 C17orf102A2RUQ5 167 aa28.34■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 IGHA2P01877 340 aa28.34■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 GSTT1P30711 240 aa28.34■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 HTR7P34969 479 aa28.34■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 CNPY1Q3B7I2 92 aa28.34■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 UGT2A3Q6UWM9 527 aa28.34■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 IFNL1Q8IU54 200 aa28.34■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 SPATA22Q8NHS9 363 aa28.34■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 USP33Q8TEY7 942 aa28.34■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 IL12RB2Q99665 862 aa28.34■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 GLOD4Q9HC38 313 aa28.34■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 CCDC78A2IDD5 438 aa28.33■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 VAPBO95292 243 aa28.33■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 PGK1P00558 417 aa28.33■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 THP07101 528 aa28.33■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 CD1EP15812 388 aa28.33■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 PAMP19021 973 aa28.33■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 CPT1AP50416 773 aa28.33■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 GEMP55040 296 aa28.33■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 NXNQ6DKJ4 435 aa28.33■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 RGMBQ6NW40 437 aa28.33■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 BEND5Q7L4P6 421 aa28.33■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 MARVELD2Q8N4S9 558 aa28.33■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 LZTR1Q8N653 840 aa28.33■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 DCUN1D1Q96GG9 259 aa28.33■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 LRGUKQ96M69 825 aa28.33■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 WDR41Q9HAD4 459 aa28.33■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa28.33■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 NEU3Q9UQ49 428 aa28.33■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 TCAF1Q9Y4C2 921 aa28.33■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 DFFAO00273 331 aa28.33■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 RGS2P41220 211 aa28.33■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 CLCN2P51788 898 aa28.33■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 CLCNKBP51801 687 aa28.33■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 DNAJB13P59910 316 aa28.33■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 ART3Q13508 389 aa28.33■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 POU6F1Q14863 301 aa28.33■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 DENND5AQ6IQ26 1287 aa28.33■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 DENND6AQ8IWF6 608 aa28.33■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 KDM1BQ8NB78 822 aa28.33■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa28.33■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 ACSS2Q9NR19 701 aa28.33■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 CACNG4Q9UBN1 327 aa28.33■■■□□ 2.13
UBP1-201ENST00000283628 TXNDC9O14530 226 aa28.32■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 CLGNO14967 610 aa28.32■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 ME2P23368 584 aa28.32■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 MPP1Q00013 466 aa28.32■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 ADGRE1Q14246 886 aa28.32■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 CEP97Q8IW35 865 aa28.32■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 IPMKQ8NFU5 416 aa28.32■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 NXNL1Q96CM4 212 aa28.32■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 KATNAL1Q9BW62 490 aa28.32■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa28.32■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 RAB26Q9ULW5 256 aa28.32■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 Q9Y3F1 56 aa28.32■■■□□ 2.12
UBP1-201ENST00000283628 CAPN8A6NHC0 703 aa28.31■■■□□ 2.12
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