RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266546.10

CLSTN3-201, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLSTN3, Length 4,185 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-201ENST00000266546 GOLGA8TH3BQL2 631 aa11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 DLGAP3O95886 979 aa11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 ERBB2P04626 1255 aa11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 KCNE1P15382 129 aa11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 ACLYP53396 1101 aa11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 GDF10P55107 478 aa11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 DEFA1P59665 94 aa11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 DEFA3P59666 94 aa11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 PEX6Q13608 980 aa11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 CDH19Q9H159 772 aa11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 HACD3Q9P035 362 aa11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 CNTN3Q9P232 1028 aa11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 GABRQQ9UN88 632 aa11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 RAP2CQ9Y3L5 183 aa11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 H7C4K7 107 aa11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 F9P00740 461 aa11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 LDLRP01130 860 aa11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 INHAP05111 366 aa11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 TPH1P17752 444 aa11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 CD52P31358 61 aa11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 PTPN7P35236 360 aa11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 MTTPP55157 894 aa11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 DLG1Q12959 904 aa11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 CBX3Q13185 183 aa11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 GPR107Q5VW38 600 aa11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 CMC1Q7Z7K0 106 aa11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 RELL1Q8IUW5 271 aa11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 ANKRD52Q8NB46 1076 aa11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 ULK4Q96C45 1275 aa11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 PHF21BQ96EK2 531 aa11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 C1orf50Q9BV19 199 aa11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa11.67□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 A0A0A0MRY4 1105 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 MAGEB16A2A368 324 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 HAS3O00219 553 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 ACO1P21399 889 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 LRPAP1P30533 357 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 NAA20P61599 178 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 CYP51A1Q16850 503 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 BTBD8Q5XKL5 378 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 FNIP1Q8TF40 1166 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 DCAKDQ8WVC6 231 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 RSPH1Q8WYR4 309 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 MAGED4Q96JG8 741 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 SPATA13Q96N96 652 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 MIPEPQ99797 713 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 BCO2Q9BYV7 579 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 CDH9Q9ULB4 789 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 PADI3Q9ULW8 664 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 KAT6AQ92794 2004 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 WDR90Q96KV7 1748 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 ANXA9O76027 345 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 JCHAINP01591 159 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 RBP1P09455 135 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 GRIA4P48058 902 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 GPX6P59796 221 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 SLC6A3Q01959 620 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 NR1D2Q14995 579 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 PTPN20Q4JDL3 420 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 CMPK2Q5EBM0 449 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 METTL21CQ5VZV1 264 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 CCDC103Q8IW40 242 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 DSELQ8IZU8 1212 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 MYO1HQ8N1T3 1032 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 TRPC4APQ8TEL6 797 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 BORCS5Q969J3 196 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 BDH2Q9BUT1 245 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 TMEM114B3SHH9 223 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 VAPBO95292 243 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 NCAM1P13591 858 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 NADK2Q4G0N4 442 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 ZNF618Q5T7W0 954 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 RUBCNLQ9H714 662 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 SNX15Q9NRS6 342 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 STK39Q9UEW8 545 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa11.66□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 E5RI56 91 aa11.65□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 H3BNX3 289 aa11.65□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 ARHGEF9O43307 516 aa11.65□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 CDH3P22223 829 aa11.65□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 ASPAP45381 313 aa11.65□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 SCNN1GP51170 649 aa11.65□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 TUSC3Q13454 348 aa11.65□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 TMEM63BQ5T3F8 832 aa11.65□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 OVOS1Q6IE37 1185 aa11.65□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 SLC35B2Q8TB61 432 aa11.65□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 KATNBL1Q9H079 304 aa11.65□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 SP110Q9HB58 689 aa11.65□□□□□ -0.54
CLSTN3-201ENST00000266546 HMG20AQ9NP66 347 aa11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms