RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263202.14

UFD1-201, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UFD1, Length 1,814 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1-201ENST00000263202 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa23.01■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 ANKMY2Q8IV38 441 aa23.01■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 AHI1Q8N157 1196 aa23.01■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 IPMKQ8NFU5 416 aa23.01■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 OR52K1Q8NGK4 314 aa23.01■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 MRGPRX2Q96LB1 330 aa23.01■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 CASS4Q9NQ75 786 aa23.01■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 VPS45Q9NRW7 570 aa23.01■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 LHX3Q9UBR4 397 aa23.01■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 TEX264Q9Y6I9 313 aa23.01■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 NUMBLQ9Y6R0 609 aa23.01■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 ANHXE9PGG2 379 aa23■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 MBTPS2O43462 519 aa23■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 TULP3O75386 442 aa23■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 TTC4O95801 387 aa23■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 ADRA1AP35348 466 aa23■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 SLC20A2Q08357 652 aa23■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 HTR4Q13639 388 aa23■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 GEN1Q17RS7 908 aa23■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 TMEM215Q68D42 235 aa23■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 CPA6Q8N4T0 437 aa23■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 EXOC2Q96KP1 924 aa23■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 GUCD1Q96NT3 240 aa23■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa23■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 GDI1P31150 447 aa22.99■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 ELK3P41970 407 aa22.99■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 LINC00523Q86TU6 105 aa22.99■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 IGDCC3Q8IVU1 814 aa22.99■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 IQCKQ8N0W5 287 aa22.99■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 FBXO36Q8NEA4 188 aa22.99■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 SIGLEC10Q96LC7 697 aa22.99■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 TBL1YQ9BQ87 522 aa22.99■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 APOL2Q9BQE5 337 aa22.99■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 FICDQ9BVA6 458 aa22.99■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 AGTP01019 485 aa22.98■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 FOSL2P15408 326 aa22.98■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 STK19P49842 368 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 WNT3AP56704 352 aa22.98■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 SULT2A1Q06520 285 aa22.98■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 NR1H3Q13133 447 aa22.98■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 SLC29A2Q14542 456 aa22.98■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 CFAP58Q5T655 872 aa22.98■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 MBLAC2Q68D91 279 aa22.98■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 PYROXD1Q8WU10 500 aa22.98■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 TTC17Q96AE7 1141 aa22.98■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 LRRC39Q96DD0 335 aa22.98■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 NUDCD1Q96RS6 583 aa22.98■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 NOD2Q9HC29 1040 aa22.98■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 GTSE1Q9NYZ3 720 aa22.98■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 HS3ST2Q9Y278 367 aa22.98■■□□□ 1.27
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UFD1-201ENST00000263202 MYLKQ15746 1914 aa22.98■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa22.98■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 ACSL3O95573 720 aa22.98■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 SRCP12931 536 aa22.98■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 SLC6A11P48066 632 aa22.98■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 SCNN1BP51168 640 aa22.98■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 RHOAP61586 193 aa22.98■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 ECT2LQ008S8 904 aa22.98■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 PCSK7Q16549 785 aa22.98■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 CCDC38Q502W7 563 aa22.98■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 RANBP10Q6VN20 620 aa22.98■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 RNF135Q8IUD6 432 aa22.98■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 MPP5Q8N3R9 675 aa22.98■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 ATP11CQ8NB49 1132 aa22.98■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 PPM1EQ8WY54 764 aa22.98■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 NSMCE3Q96MG7 304 aa22.98■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 TTC25Q96NG3 672 aa22.98■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 FSD1LQ9BXM9 530 aa22.98■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 SLC25A13Q9UJS0 675 aa22.98■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 CHMP2BQ9UQN3 213 aa22.98■■□□□ 1.27
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UFD1-201ENST00000263202 SERPINF2P08697 491 aa22.97■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 CES1P23141 567 aa22.97■■□□□ 1.27
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UFD1-201ENST00000263202 SLC14A2Q15849 920 aa22.97■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 ALS2CLQ60I27 953 aa22.97■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 DENND2CQ68D51 928 aa22.97■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 DENND5AQ6IQ26 1287 aa22.97■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 DNAAF3Q8N9W5 541 aa22.97■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 TTC8Q8TAM2 541 aa22.97■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa22.97■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 ZIM3Q96PE6 472 aa22.97■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa22.97■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 SCUBE2Q9NQ36 999 aa22.97■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 PLAAQ9Y263 795 aa22.97■■□□□ 1.27
UFD1-201ENST00000263202 MGAT1P26572 445 aa22.96■■□□□ 1.27
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