RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 AP2B1P63010 937 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 ZXDBP98169 803 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGAP18Q8N392 663 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 E2F7Q96AV8 911 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 RTP4Q96DX8 246 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 NUDT5Q9UKK9 219 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 NARSO43776 548 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 KRT38O76015 456 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 FGF19O95750 216 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 LCP1P13796 627 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 MAGEA6P43360 314 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 ADIGQ0VDE8 80 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 SMTNL2Q2TAL5 461 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 SCD5Q86SK9 330 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 MON1AQ86VX9 555 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 SCUBE1Q8IWY4 988 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 CMTM8Q8IZV2 173 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 CLEC4CQ8WTT0 213 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR60Q8WVS4 1066 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 SMARCD2Q92925 531 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 ULBP1Q9BZM6 244 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 NMUR2Q9GZQ4 415 aa26.77■■□□□ 1.88
CAPNS1-201ENST00000246533 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
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CAPNS1-201ENST00000246533 FKBP6O75344 327 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 GABRB2P47870 512 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 ARCQ7LC44 396 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 BHLHA9Q7RTU4 235 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 CRLF3Q8IUI8 442 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 IGDCC3Q8IVU1 814 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC44A3Q8N4M1 653 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 JOSD2Q8TAC2 188 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGEF4Q9NR80 690 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 SCML2Q9UQR0 700 aa26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PQH9 124 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM49D1C9J1S8 452 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 TBX18O95935 607 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 SETSIPP0DME0 302 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 STILQ15468 1287 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 XYLT1Q86Y38 959 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 MIS12Q9H081 205 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
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CAPNS1-201ENST00000246533 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 SERPINB9P50453 376 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 TUBP50607 506 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 ACTR3P61158 418 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNT1Q5JUK3 1230 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 AAGABQ6PD74 315 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 TTC16Q8NEE8 873 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 FAF2Q96CS3 445 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXO44Q9H4M3 255 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 TTLL3Q9Y4R7 772 aa26.75■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 CNTFP26441 200 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 MIPP30301 263 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 TMPRSS15P98073 1019 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 WASHC5Q12768 1159 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 GRM2Q14416 872 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 TMCO4Q5TGY1 634 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP7D3Q8IWC1 876 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC4Q9HBW1 653 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 PLA2G4CQ9UP65 541 aa26.74■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 C1QAP02745 245 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 SERPINA6P08185 405 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 VITQ6UXI7 678 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 SCUBE3Q8IX30 993 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 MCUQ8NE86 351 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 KCTD13Q8WZ19 329 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 KLC2Q9H0B6 622 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM96AQ9H5X1 160 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 ZFP14Q9HCL3 533 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 HDCP19113 662 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 BST1Q10588 318 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 HFE2Q6ZVN8 426 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 UCMAQ8WVF2 138 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 CALN1Q9BXU9 219 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 C10orf88Q9H8K7 445 aa26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 YJEFN3A6XGL0 299 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 HEPACAM2A8MVW5 462 aa26.72■■□□□ 1.87
CAPNS1-201ENST00000246533 COCHO43405 550 aa26.72■■□□□ 1.87
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