RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000058845.8

Basp1-201, Transcript of Brain acid soluble protein 1, mouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Basp1, Length 1,855 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Elk3	P41971	409 aa		24.21	■■□□□ 1.47
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Rin3	P59729	980 aa		24.21	■■□□□ 1.47
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Rela	Q04207	549 aa		24.21	■■□□□ 1.47
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Fam47c	Q14BE7	430 aa		24.21	■■□□□ 1.47
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Colec11	Q3SXB8	272 aa		24.21	■■□□□ 1.47
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Gpatch4	Q3TFK5	415 aa	Known RBP	24.21	■■□□□ 1.47
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Alkbh5	Q3TSG4	395 aa	Known RBP	24.21	■■□□□ 1.47
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Fam8a1	Q3URQ4	399 aa		24.21	■■□□□ 1.47
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Zfp791	Q497V9	528 aa		24.21	■■□□□ 1.47
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Tmem255b	Q5FW56	369 aa		24.21	■■□□□ 1.47
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Nemf	Q8CCP0	1064 aa	Known RBP	24.21	■■□□□ 1.47
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Nup85	Q8R480	656 aa	Known RBP	24.21	■■□□□ 1.47
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Exoc2	Q9D4H1	924 aa		24.21	■■□□□ 1.47
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Otof	Q9ESF1	1997 aa		24.2	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845		A0A286YCD0	109 aa		24.2	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Ism2	D3Z6A3	493 aa		24.2	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Vmn2r59	E9PUT5	865 aa		24.2	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Cyp4a14	O35728	507 aa		24.2	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Pdgfrb	P05622	1098 aa		24.2	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Sbk3	P0C5K0	361 aa		24.2	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Eml1	Q05BC3	814 aa		24.2	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Sdf4	Q61112	361 aa		24.2	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Papola	Q61183	739 aa		24.2	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Phc1	Q64028	1012 aa		24.2	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Amer3	Q6NS69	780 aa		24.2	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Ints6	Q6PCM2	883 aa		24.2	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Asl	Q91YI0	464 aa		24.2	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Trbv4	A0A075B5I2	113 aa		24.19	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Gm7275	E9Q1B3	247 aa		24.19	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Exoc7	O35250	697 aa		24.19	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Tnfaip2	Q61333	691 aa		24.19	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Thrsp	Q62264	150 aa		24.19	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Lingo3	Q6GQU6	589 aa		24.19	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Elp6	Q8BK75	266 aa		24.19	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Tarsl2	Q8BLY2	790 aa		24.19	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Lrrc4c	Q8C031	640 aa		24.19	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Fam204a	Q8C6C7	236 aa		24.19	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	P3h4	Q8K2B0	443 aa		24.19	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Acot13	Q9CQR4	140 aa		24.19	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Pdilt	Q9DAN1	588 aa		24.19	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Morc3	F7BJB9	942 aa	Known RBP	24.19	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Per3	O70361	1113 aa		24.19	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Penk	P22005	268 aa		24.19	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Hspa4l	P48722	838 aa		24.19	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Znf148	Q61624	794 aa		24.19	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Nuak1	Q641K5	658 aa		24.19	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Msantd1	Q8BIL2	278 aa		24.19	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Ppp4r1	Q8K2V1	951 aa		24.19	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Slc30a5	Q8R4H9	761 aa		24.19	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Acsf2	Q8VCW8	615 aa		24.19	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Necab2	Q91ZP9	389 aa		24.19	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Smok2b	Q9QYZ3	484 aa		24.19	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Smok2a	Q9QYZ6	504 aa		24.19	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Vwa5b1	A9Z1V5	1215 aa		24.18	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Zfp963	D3Z2T8	383 aa		24.18	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Gm3424	L7N298	263 aa		24.18	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Gm8246	M0QWX9	263 aa		24.18	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Gp1ba	O35930	734 aa		24.18	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Chka	O54804	453 aa		24.18	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Ccl4	P14097	92 aa		24.18	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Tnfrsf4	P47741	272 aa		24.18	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Cog7	Q3UM29	770 aa		24.18	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Inpp4b	Q6P1Y8	924 aa		24.18	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Stambpl1	Q76N33	436 aa		24.18	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Tbc1d17	Q8BYH7	645 aa		24.18	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Ccdc187	Q8C5V8	958 aa		24.18	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Efcab8	Q8C9R9	203 aa		24.18	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Vmn1r206	Q8R277	312 aa		24.18	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Fhl5	Q9WTX7	284 aa		24.18	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Cdc7	Q9Z0H0	564 aa		24.18	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Ror1	Q9Z139	937 aa		24.18	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Got2	P05202	430 aa	Known RBP	24.17	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Zfp1	P08042	402 aa		24.17	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Pabpc1	P29341	636 aa	Known RBP	24.17	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Kdm7a	Q3UWM4	940 aa		24.17	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Spata48	Q5NC83	441 aa		24.17	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Hs3st2	Q673U1	367 aa		24.17	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Galnt10	Q6P9S7	603 aa		24.17	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Nup93	Q8BJ71	819 aa	Known RBP	24.17	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Spp2	Q8K1I3	203 aa		24.17	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Olfr784	Q8VFZ9	319 aa		24.17	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Mpp5	Q9JLB2	675 aa		24.17	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Pcm1	Q9R0L6	2025 aa		24.17	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	6720489N17Rik	A0A1Y7VJW0	127 aa		24.17	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Card9	A2AIV8	536 aa		24.17	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Skint8	A7XV07	398 aa		24.17	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Zfp952	B0V2W4	504 aa		24.17	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Rax	O35602	342 aa		24.17	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Mip	P51180	263 aa		24.17	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Opa1	P58281	960 aa		24.17	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Erg	P81270	486 aa		24.17	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Aars2	Q14CH7	980 aa		24.17	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Zmym5	Q3U2E2	627 aa		24.17	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Ccnh	Q61458	323 aa		24.17	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Fam221b	Q8C627	487 aa		24.17	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Kctd2	Q8CEZ0	266 aa		24.17	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Tdrd12	Q9CWU0	1215 aa		24.17	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Ctsr	Q9JIA9	334 aa		24.17	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Il17d	A0A0B4J1G4	205 aa		24.16	■■□□□ 1.46
Basp1-201	ENSMUST00000058845	Gm29133	A0A1B0GT72	266 aa		24.16	■■□□□ 1.46

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 59.3 ms