RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Trmt10aQ8C1Z8 328 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Proser2Q8C5R2 471 aa22.19■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Glcci1Q8K3I9 537 aa22.19■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Serpina3nQ91WP6 418 aa22.19■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Usp11Q99K46 921 aa22.19■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ogfod2Q9CQ04 349 aa22.19■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cmtm8Q9CZR4 173 aa22.19■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Krt20Q9D312 431 aa22.19■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Stk11Q9WTK7 436 aa22.19■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfp952B0V2W4 504 aa22.18■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Scgb2b7D3YYY1 112 aa22.18■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Serpina3iD3Z450 408 aa22.18■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Vmn2r86G5E8Y4 848 aa22.18■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 5730507C01RikJ3QPX0 416 aa22.18■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 DldO08749 509 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sypl1O09117 261 aa22.18■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 P01810 119 aa22.18■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pebp1P70296 187 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 4930502E18RikQ14BQ3 236 aa22.18■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmem255bQ5FW56 369 aa22.18■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PterQ60866 349 aa22.18■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Il10raQ61727 575 aa22.18■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 PrkciQ62074 595 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Eif2aQ8BJW6 581 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ano4Q8C5H1 955 aa22.18■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Trip10Q8CJ53 603 aa22.18■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mill1Q8HWE7 395 aa22.18■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cdk5rap3Q99LM2 503 aa22.18■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 NtpcrQ9CQA9 190 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rnf135Q9CWS1 417 aa22.18■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nlrp1bA1Z198 1177 aa22.17■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lonrf1D3YY23 762 aa22.17■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Vmn2r94E9PZK8 818 aa22.17■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Atp2a2O55143 1044 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc7a2P18581 657 aa22.17■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Smpdl3bP58242 456 aa22.17■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 RnaselQ05921 735 aa22.17■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lcp1Q61233 627 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tra2aQ6PFR5 281 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 TdrkhQ80VL1 560 aa22.17■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm6377Q8BHV4 303 aa22.17■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccdc40Q8BI79 1192 aa22.17■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ptk7Q8BKG3 1062 aa22.17■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dus1lQ8C2P3 475 aa22.17■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Znf668Q8K2R5 619 aa22.17■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Mlc1Q8VHK5 382 aa22.17■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Wdr6Q99ME2 1125 aa22.17■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 LipfQ9CPP7 395 aa22.17■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Nudt8Q9CR24 210 aa22.17■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 SrpraQ9DBG7 636 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Riok3Q9DBU3 519 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 EefsecQ9JHW4 583 aa22.17■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Brca2P97929 3329 aa22.17■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 CrebbpP45481 2441 aa22.17■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gvin1Q80SU7 2427 aa22.17■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ptpn1P35821 432 aa22.16■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gdi1P50396 447 aa22.16■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 St14P56677 855 aa22.16■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 MybphP70402 483 aa22.16■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cuzd1P70412 606 aa22.16■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Prss53Q571E5 552 aa22.16■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 HnrnpdQ60668 355 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cdc14bQ6PFY9 485 aa22.16■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccdc154Q6RUT8 657 aa22.16■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Maml1Q6T264 1020 aa22.16■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dnajc15Q78YY6 149 aa22.16■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Usp43Q8BUM9 1132 aa22.16■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmem259Q8CIV2 574 aa22.16■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pnpla8Q8K1N1 776 aa22.16■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccdc137Q8R0K4 290 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Vps18Q8R307 973 aa22.16■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr589Q8VGV8 317 aa22.16■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Macrod1Q922B1 323 aa22.16■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ecrg4Q99LS0 148 aa22.16■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Trim12aQ99PQ1 284 aa22.16■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rmi1Q9D4G9 616 aa22.16■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Exoc2Q9D4H1 924 aa22.16■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ppm1dQ9QZ67 598 aa22.16■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Igkv6-29A0A0G2JEI6 115 aa22.15■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfp811A0A0J9YU71 552 aa22.15■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 A0A1L1STL9 112 aa22.15■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Klhl41A2AUC9 606 aa22.15■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tcte1A6H639 498 aa22.15■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Psma3O70435 255 aa22.15■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sipa1P46062 1037 aa22.15■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Igfbp2P47877 305 aa22.15■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Atxn1P54254 791 aa22.15■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Acot8P58137 320 aa22.15■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Npy2rP97295 381 aa22.15■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pde1bQ01065 535 aa22.15■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cd300lgQ1ERP8 331 aa22.15■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pyroxd1Q3TMV7 498 aa22.15■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm13103Q4VAD2 491 aa22.15■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tsr1Q5SWD9 803 aa22.15■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kiaa0895Q7TQE7 519 aa22.15■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tecpr1Q80VP0 1166 aa22.15■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ddrgk1Q80WW9 315 aa22.15■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Spp2Q8K1I3 203 aa22.15■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 HpdlQ8K248 371 aa22.15■■□□□ 1.14
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slco3a1Q8R3L5 710 aa22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37.5 ms