RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ap3d1O54774 1199 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sftpa1P35242 248 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Stmn1P54227 149 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Itga4Q00651 1039 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ugt3a1Q3UP75 523 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem232Q5K6N0 675 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PighQ5M9N4 188 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nt5eQ61503 576 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Itga7Q61738 1179 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam167aQ6P1G6 215 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 InavaQ7TN12 663 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ctdp1Q7TSG2 960 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Armc12Q80X86 340 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Camta2Q80Y50 1208 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Exoc3l1Q8BI71 739 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 L3mbtl3Q8BLB7 883 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hook3Q8BUK6 718 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Arrb1Q8BWG8 418 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NotumQ8R116 503 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp617Q91WM0 559 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 March2Q99M02 246 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdc42ep3Q9CQC5 254 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prr23a3Q9CWP9 254 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rnf135Q9CWS1 417 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PmpcbQ9CXT8 489 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MtrexQ9CZU3 1040 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ttc33Q9D6K7 262 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mrpl17Q9D8P4 176 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rmdn1Q9DCV4 305 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fstl3Q9EQC7 256 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 FignQ9ERZ6 759 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Caln1Q9JJG7 219 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Uchl3Q9JKB1 230 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dio2Q9Z1Y9 266 aa11.36□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Igkv17-127A0A0G2JDN5 117 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn2r34E9PVI0 852 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn2r37F8VQD3 802 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr694K7N641 315 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Srpk1O70551 648 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Anxa6P14824 673 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Marcksl1P28667 200 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Serpina3cP29621 417 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Htr7P32304 448 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cd59bP58019 129 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SgcgP82348 291 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Eml1Q05BC3 814 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Shcbp1lQ3TTP0 639 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ntrk1Q3UFB7 799 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cog7Q3UM29 770 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pla2g4dQ50L43 825 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MybphlQ5FW53 355 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Taar8aQ5QD07 344 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tfap2bQ61313 459 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Itga3Q62470 1053 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Muc19Q6JHY2 733 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trpm4Q7TN37 1213 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MroQ7TNB4 248 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Glra2Q7TNC8 452 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ino80cQ8BHA0 191 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gtf3c4Q8BMQ2 817 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Phactr3Q8BYK5 558 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 4921504E06RikQ8CET2 560 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Plekho2Q8K124 495 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MfrpQ8K480 584 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1176Q8VG40 315 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1019Q8VGS3 310 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r71Q8VIC0 307 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cybrd1Q925G2 290 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fcf1Q9CTH6 198 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klhl35Q9CZ49 574 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Exoc2Q9D4H1 924 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Syap1Q9D5V6 365 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cnot8Q9D8X5 292 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf654Q9DAU9 571 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lonp2Q9DBN5 852 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 D7h11orf16Q9JJR6 402 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SrfQ9JM73 504 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tubd1Q9R1K7 455 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pex11bQ9Z210 259 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dpp6Q9Z218 804 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pck1Q9Z2V4 622 aa11.35□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SvilQ8K4L3 2170 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm13101A2ASJ0 481 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kcng1A2BDX4 514 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sec14l1A8Y5H7 715 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdh19E9Q3A7 770 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zscan4bE9Q3G0 505 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp169E9Q3R6 731 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm3127E9Q9P5 263 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm3453K7N724 263 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Agpat1O35083 285 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NoctO35710 429 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CaluO35887 315 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tspan6O70401 245 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NagluO88325 739 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P01657 111 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ctla2bP12400 113 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cyr61P18406 379 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tap1P21958 724 aa11.34□□□□□ -0.59
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 ZfaP23607 742 aa11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.1 ms