RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641250.1

5S_rRNA.29-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 107 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 SLC17A9Q9BYT1 436 aa6.61□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 FAM204AQ9H8W3 233 aa6.61□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 SIX2Q9NPC8 291 aa6.61□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 MAN1B1Q9UKM7 699 aa6.61□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 FADS3Q9Y5Q0 445 aa6.61□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 DRGXA6NNA5 263 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 AGRPO00253 132 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 MUSKO15146 869 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 THAP12O43422 761 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 CLDN11O75508 207 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 GP1BAP07359 652 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 KRT5P13647 590 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 HGFP14210 728 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 NME1P15531 152 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 ITGB6P18564 788 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 CCR1P32246 355 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 CLCN1P35523 988 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 NUDT1P36639 197 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 ACVRL1P37023 503 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 NNMTP40261 264 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 ACADSBP45954 432 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 CXCR3P49682 368 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 ERVPABLB-1P60509 514 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 PFN3P60673 137 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 NUCB2P80303 420 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 ARF5P84085 180 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 CDK17Q00537 523 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 LRRC63Q05C16 580 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 TCEA2Q15560 299 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 ARHGAP44Q17R89 818 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 ARL13BQ3SXY8 428 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 CCDC40Q4G0X9 1142 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 RABGAP1LQ5R372 815 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 FAM46CQ5VWP2 391 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 KLHL10Q6JEL2 608 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 IGF2-ASQ6U949 168 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 ATP11CQ8NB49 1132 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 OR6K2Q8NGY2 324 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 NT5C3BQ969T7 300 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 CEP63Q96MT8 703 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 GSDMAQ96QA5 445 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 DEPDC7Q96QD5 511 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 TBCBQ99426 244 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 NPY6RQ99463 290 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 DPH1Q9BZG8 443 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 KLC2Q9H0B6 622 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 MUC3BQ9H195 1237 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 CLMPQ9H6B4 373 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 SLC25A13Q9UJS0 675 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 CSMD1Q96PZ7 3565 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 A0A1W2PQM1 296 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 A6NNZ2 444 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 FAM72CH0Y354 149 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 M0QYT0 321 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 BIN1O00499 593 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 YY2O15391 372 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 ARHGAP6O43182 974 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 SART1O43290 800 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 AQP9O43315 295 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 SLC28A2O43868 658 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 MAGEC1O60732 1142 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 WISP1O95388 367 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 RHOCP08134 193 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 ADRB3P13945 408 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 TSHRP16473 764 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 JUNDP17535 347 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 GNA15P30679 374 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 AKT2P31751 481 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 L1CAMP32004 1257 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 IGFALSP35858 605 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 FLT3P36888 993 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 ETV5P41161 510 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 ADKP55263 362 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 CDH4P55283 916 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 CYP4F2P78329 520 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 SLC6A3Q01959 620 aa6.59□□□□□ -1.35
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms