RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639525.1

SPIN3-223, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SPIN3, Length 3,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-223	ENST00000639525	TIPRL	O75663	272 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	IL4R	P24394	825 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	LRPAP1	P30533	357 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	CD86	P42081	329 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	GEM	P55040	296 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	TWF1	Q12792	350 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	SEMA5A	Q13591	1074 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	PCLAF	Q15004	111 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM110	Q86TL2	294 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	HBEGF	Q99075	208 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	IRF1	P10914	325 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	ITGAX	P20702	1163 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	LIPM	Q5VYY2	423 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	C16orf87	Q6PH81	154 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	STRADA	Q7RTN6	431 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	C12orf42	Q96LP6	360 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	AP4S1	Q9Y587	144 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	UTRN	P46939	3433 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	NPY2R	P49146	381 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	SCNN1B	P51168	640 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	LIMK2	P53671	638 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	TAS2R39	P59534	338 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	MFSD10	Q14728	455 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	MARC1	Q5VT66	337 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	MBLAC2	Q68D91	279 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	MFN1	Q8IWA4	741 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	MIER2	Q8N344	545 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	ESAM	Q96AP7	390 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	CD274	Q9NZQ7	290 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	CROT	Q9UKG9	612 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	IPP	Q9Y573	584 aa		11.92	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	SH3BP5	O60239	455 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC7A2	P52569	658 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	NEDD8	Q15843	81 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	GPC2	Q8N158	579 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	TINF2	Q9BSI4	451 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	APOL5	Q9BWW9	433 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	ABHD16B	Q9H3Z7	469 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	RGS18	Q9NS28	235 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525		C9IYK1	514 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	KATNA1	O75449	491 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	GJA9	P57773	515 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM35A	Q86V20	835 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	HDAC10	Q969S8	669 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	PCED1B	Q96HM7	432 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	EURL	Q9NYK6	297 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	PGK1	P00558	417 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	PTPN9	P43378	593 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	RAB10	P61026	200 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	NFYC	Q13952	458 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF410	Q86VK4	478 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	FZD10	Q9ULW2	581 aa		11.91	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	MAGEB16	A2A368	324 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	OR51F1	A6NGY5	319 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	NCAM2	O15394	837 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	TADA2A	O75478	443 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	AP2A1	O95782	977 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	SMPD1	P17405	629 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	CKMT2	P17540	419 aa		11.9	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
SPIN3-223	ENST00000639525	CLCNKB	P51801	687 aa		11.9	□□□□□ -0.5

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