RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635562.1

PSPC1-208, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 3

Gene PSPC1, Length 422 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-208ENST00000635562 ZSCAN32Q9NX65 697 aa3.1□□□□□ -1.91
PSPC1-208ENST00000635562 SYBUQ9NX95 663 aa3.1□□□□□ -1.91
PSPC1-208ENST00000635562 CACNG4Q9UBN1 327 aa3.1□□□□□ -1.91
PSPC1-208ENST00000635562 MORF4L1Q9UBU8 362 aa3.1□□□□□ -1.91
PSPC1-208ENST00000635562 FAM153AQ9UHL3 310 aa3.1□□□□□ -1.91
PSPC1-208ENST00000635562 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
PSPC1-208ENST00000635562 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
PSPC1-208ENST00000635562 NOX1Q9Y5S8 564 aa3.1□□□□□ -1.91
PSPC1-208ENST00000635562 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
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PSPC1-208ENST00000635562 VEZTQ9HBM0 779 aa3.09□□□□□ -1.91
PSPC1-208ENST00000635562 ZBTB26Q9HCK0 441 aa3.09□□□□□ -1.91
PSPC1-208ENST00000635562 ERVK-5Q9HDB9 667 aa3.09□□□□□ -1.91
PSPC1-208ENST00000635562 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa3.09□□□□□ -1.91
PSPC1-208ENST00000635562 NMRK1Q9NWW6 199 aa3.09□□□□□ -1.91
PSPC1-208ENST00000635562 UBAP1Q9NZ09 502 aa3.09□□□□□ -1.91
PSPC1-208ENST00000635562 COQ3Q9NZJ6 369 aa3.09□□□□□ -1.91
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