RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 MUSKO15146 869 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 RAD51BO15315 384 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 DAB1O75553 588 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 ADRB3P13945 408 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1R2P41236 205 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 SGCGQ13326 291 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 FGL2Q14314 439 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
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CAPNS1-217ENST00000629983 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 ARL14Q8N4G2 192 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 TPCN2Q8NHX9 752 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 SPATA20Q8TB22 786 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 NELFBQ8WX92 580 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 SPON2Q9BUD6 331 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 TKTL2Q9H0I9 626 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 CTNND2Q9UQB3 1225 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 ATMQ13315 3056 aa27.93■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 DOCK9Q9BZ29 2069 aa27.92■■■□□ 2.06
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CAPNS1-217ENST00000629983 C5orf22Q49AR2 442 aa27.92■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 TTI2Q6NXR4 508 aa27.92■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM59Q8IWR1 403 aa27.92■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 GLMNQ92990 594 aa27.92■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 WDCPQ9H6R7 721 aa27.92■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR27Q9NS67 375 aa27.92■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 SALL4Q9UJQ4 1053 aa27.92■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa27.92■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 WASF2Q9Y6W5 498 aa27.92■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 COL6A6A6NMZ7 2263 aa27.92■■■□□ 2.06
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CAPNS1-217ENST00000629983 PMS2P1A4D2B8 440 aa27.91■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGAP6O43182 974 aa27.91■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 RPIAP49247 311 aa27.91■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 GJB7Q6PEY0 223 aa27.91■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 OLFML1Q6UWY5 402 aa27.91■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa27.91■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
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CAPNS1-217ENST00000629983 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP27.91■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 PIGVQ9NUD9 493 aa27.91■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 MPP6Q9NZW5 540 aa27.91■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 KLF15Q9UIH9 416 aa27.91■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 FADS3Q9Y5Q0 445 aa27.91■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 MAST4O15021 2626 aa27.91■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 NEMP1O14524 444 aa27.9■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 TNFSF15O95150 251 aa27.9■■■□□ 2.06
CAPNS1-217ENST00000629983 WISP1O95388 367 aa27.9■■■□□ 2.06
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CAPNS1-217ENST00000629983 PERM1Q5SV97 790 aa27.9■■■□□ 2.06
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CAPNS1-217ENST00000629983 SSUH2Q9Y2M2 353 aa27.88■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 MYO18BQ8IUG5 2567 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC187A0A096LP49 1063 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 BECN2A8MW95 431 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 CDRT15L2A8MXV6 281 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-217ENST00000629983 TPP1O14773 563 aa27.87■■■□□ 2.05
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