RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 LTFP02788 710 aa21.97■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 NOS2P35228 1153 aa21.97■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 ITIH4Q14624 930 aa21.97■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 FSTL4Q6MZW2 842 aa21.97■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 ANKMY2Q8IV38 441 aa21.97■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 FBXO36Q8NEA4 188 aa21.97■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 DYDC1Q8WWB3 177 aa21.97■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 SLC2A13Q96QE2 648 aa21.97■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 IER2Q9BTL4 223 aa21.97■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa21.97■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF510Q9Y2H8 683 aa21.97■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 FAM47DPA6NHR8 397 aa21.96■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 GCATO75600 419 aa21.96■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 IFT88Q13099 833 aa21.96■■□□□ 1.11
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SGMS1-210ENST00000619438 SLC45A4Q5BKX6 768 aa21.96■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 TPGS1Q6ZTW0 290 aa21.96■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 TMEM25Q86YD3 366 aa21.96■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 DEFB106AQ8N104 65 aa21.96■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC197Q8NCU1 140 aa21.96■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 CSPG4P5Q96PW8 444 aa21.96■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 NPY6RQ99463 290 aa21.96■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 KLC2Q9H0B6 622 aa21.96■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 FZD10Q9ULW2 581 aa21.96■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 HEY1Q9Y5J3 304 aa21.96■■□□□ 1.11
SGMS1-210ENST00000619438 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 CAPN9O14815 690 aa21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 GREM1O60565 184 aa21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 EGFP01133 1207 aa21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 NCAM1P13591 858 aa21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 RBL1P28749 1068 aa21.95■■□□□ 1.1
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SGMS1-210ENST00000619438 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 ADGRD1Q6QNK2 874 aa21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 Q6ZS52 159 aa21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 NAT16Q8N8M0 369 aa21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 MCUQ8NE86 351 aa21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 TEX264Q9Y6I9 313 aa21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 HACD1B0YJ81 288 aa21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 BANF1O75531 89 aa21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 VIMP08670 466 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 CXCL12P48061 93 aa21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 CCR3P51677 355 aa21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 BBS9Q3SYG4 887 aa21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 FBXO43Q4G163 708 aa21.95■■□□□ 1.1
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SGMS1-210ENST00000619438 PALM2Q8IXS6 379 aa21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 C10orf67Q8IYJ2 551 aa21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 SPEM1Q8N4L4 309 aa21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC185Q8N715 623 aa21.95■■□□□ 1.1
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SGMS1-210ENST00000619438 MAGEB18Q96M61 343 aa21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP21.95■■□□□ 1.14e-10■■■■□ 20.2
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SGMS1-210ENST00000619438 STAP1Q9ULZ2 295 aa21.95■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 FRYLO94915 3013 aa21.94■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 ANKRD65E5RJM6 399 aa21.94■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 CPP00450 1065 aa21.94■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 KLKB1P03952 638 aa21.94■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 SP9P0CG40 484 aa21.94■■□□□ 1.1
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SGMS1-210ENST00000619438 OPRD1P41143 372 aa21.94■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 SLC6A11P48066 632 aa21.94■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 SULT1E1P49888 294 aa21.94■■□□□ 1.1
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SGMS1-210ENST00000619438 AIF1P55008 147 aa21.94■■□□□ 1.1
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SGMS1-210ENST00000619438 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 DENND1AQ8TEH3 1009 aa21.94■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 PLD4Q96BZ4 506 aa21.94■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 LRRC39Q96DD0 335 aa21.94■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 TRIM62Q9BVG3 475 aa21.94■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 BBS2Q9BXC9 721 aa21.94■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 RASSF4Q9H2L5 321 aa21.94■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 TRABDQ9H4I3 376 aa21.94■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 ETNK2Q9NVF9 386 aa21.94■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 FBXO4Q9UKT5 387 aa21.94■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 PIEZO1Q92508 2521 aa21.94■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa21.93■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 FOXO6A8MYZ6 492 aa21.93■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa21.93■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 ATG13O75143 517 aa21.93■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 FSBPO95073 299 aa21.93■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 ARL4AP40617 200 aa21.93■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 NRLP54845 237 aa21.93■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 LRRC14Q15048 493 aa21.93■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
SGMS1-210ENST00000619438 TSSK4Q6SA08 328 aa21.93■■□□□ 1.1
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