RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	LRP4	O75096	1905 aa		12.19	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	12.18	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	SPINT1	O43278	529 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	12.18	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	GP1BA	P07359	652 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	ADRB3	P13945	408 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	12.18	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	TGM2	P21980	687 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	ITGB7	P26010	798 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	12.18	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	12.18	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	NEK3	P51956	506 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	PTK2	Q05397	1052 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	12.18	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	12.18	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	12.18	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	C2CD6	Q53TS8	623 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	GUSBP11	Q6P575	273 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	IFI44	Q8TCB0	444 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	12.18	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	IFT43	Q96FT9	208 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM81B	Q96LP2	452 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	12.18	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	12.18	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	ITM2B	Q9Y287	266 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	12.18	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		12.18	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	CD160	O95971	181 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	CSF2	P04141	144 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	ALPPL2	P10696	532 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	OR1E1	P30953	314 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	GK	P32189	559 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	KRT9	P35527	623 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	ABL2	P42684	1182 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	LSS	P48449	732 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	TMPRSS3	P57727	454 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	CFHR1	Q03591	330 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	DEUP1	Q05D60	604 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	CDKN3	Q16667	212 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	ISX	Q2M1V0	245 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB6C	Q53S08	254 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	BNIPL	Q7Z465	357 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	PARG	Q86W56	976 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	XYLT1	Q86Y38	959 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	MAPK15	Q8TD08	544 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	SPON2	Q9BUD6	331 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	12.17	□□□□□ -0.46	6e-6	■□□□□ 9.5
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	RRN3	Q9NYV6	651 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	SATB2	Q9UPW6	733 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		12.17	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	ILVBL	A1L0T0	632 aa		12.16	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	NEMP2	A6NFY4	417 aa		12.16	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	SRGAP2	O75044	1071 aa		12.16	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	L1CAM	P32004	1257 aa		12.16	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	ACVRL1	P37023	503 aa		12.16	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	12.16	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	GABRB2	P47870	512 aa		12.16	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	PDX1	P52945	283 aa		12.16	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		12.16	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	12.16	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		12.16	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	12.16	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	12.16	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		12.16	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		12.16	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	PERM1	Q5SV97	790 aa		12.16	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		12.16	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	12.16	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRC31	Q6UY01	552 aa		12.16	□□□□□ -0.46
TTLL3-233	ENST00000602338	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	12.16	□□□□□ -0.46

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