RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 PRLRP16471 622 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 GOT1P17174 413 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 TCP1P17987 556 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 OXCT1P55809 520 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 DPYSQ14117 519 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 TFDP3Q5H9I0 405 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 LY6G5CQ5SRR4 150 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 SEL1L2Q5TEA6 688 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC50Q8IVM0 306 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 GALNT15Q8N3T1 639 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 KCNV2Q8TDN2 545 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 DDI1Q8WTU0 396 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 PBKQ96KB5 322 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC2A11Q9BYW1 496 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 KLHL11Q9NVR0 708 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 NEU3Q9UQ49 428 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 KCNK3O14649 394 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 ENC1O14682 589 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 ADH5P11766 374 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 CASQ1P31415 396 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 GGCXP38435 758 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 CDKN2BP42772 138 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 MAPKAPK2P49137 400 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 CAMK2BQ13554 666 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 TFDP2Q14188 446 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 FYB2Q5VWT5 728 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 RHBDF2Q6PJF5 856 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 MFSD7Q6UXD7 560 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 RGL4Q8IZJ4 473 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 IGSF8Q969P0 613 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 RNF157Q96PX1 679 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 BBS2Q9BXC9 721 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM248Q9NWD8 314 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 TOR4AQ9NXH8 423 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 DNAI1Q9UI46 699 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 SNX12Q9UMY4 172 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 MYO18BQ8IUG5 2567 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 ESPNB1AK53 854 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 TSPAN3O60637 253 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 TBL1XO60907 577 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 CD48P09326 243 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 IL4RP24394 825 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 GRIK2Q13002 908 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 SYCP2LQ5T4T6 812 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 ARTNQ5T4W7 220 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 TPGS1Q6ZTW0 290 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM25Q86YD3 366 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF843Q8N446 348 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 LZTR1Q8N653 840 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 MAGEB5Q9BZ81 275 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 HECTD1Q9ULT8 2610 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 PYGMP11217 842 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 SERPINB6P35237 376 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 DNA2P51530 1060 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 RPS24P62847 133 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 SYT10Q6XYQ8 523 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 NLRP14Q86W24 1093 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 C12orf40Q86WS4 652 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 MARCH9Q86YJ5 346 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 DCBLD2Q96PD2 775 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 CDC6Q99741 560 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 OSBPL8Q9BZF1 889 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 CACNG3O60359 315 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF883P0CG24 379 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 TYRP14679 529 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 ERCC2P18074 760 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 ANO4Q32M45 955 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 WDR45BQ5MNZ6 344 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 C6orf118Q5T5N4 469 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 DCAF12L1Q5VU92 463 aa24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC9A4Q6AI14 798 aa24.12■■□□□ 1.45
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