RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591971.5

PDE4A-208, Transcript of phosphodiesterase 4A, human

TSL 5

Gene PDE4A, Length 836 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4A-208	ENST00000591971	ANKRD62	A6NC57	917 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	12.75	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	ARHGAP6	O43182	974 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	SLC7A4	O43246	635 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	PCDHGA12	O60330	932 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	TRIM16	O95361	564 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	ADRA1B	P35368	520 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	PTPN9	P43378	593 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	LINGO4	Q6UY18	593 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	STRADA	Q7RTN6	431 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	CCDC185	Q8N715	623 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	GANC	Q8TET4	914 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	MUC3B	Q9H195	1237 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971		A0A087X0T9	212 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	FLRT2	O43155	660 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	SRGAP2	O75044	1071 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	FAM228B	P0C875	321 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	OR1E1	P30953	314 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	ACVRL1	P37023	503 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	IL9R	Q01113	521 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	TEAD4	Q15561	434 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	CDO1	Q16878	200 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	ACCSL	Q4AC99	568 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	LRRC31	Q6UY01	552 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	H2AFV	Q71UI9	128 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	TRIM69	Q86WT6	500 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	TMIE	Q8NEW7	156 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	PARVA	Q9NVD7	372 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	MYLK	Q15746	1914 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	TAF4	O00268	1085 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	LRIG2	O94898	1065 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	NDUFA10	O95299	355 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	CD38	P28907	300 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	CHRNA3	P32297	505 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	MAGEA1	P43355	309 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	CLCN6	P51797	869 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	NXPH1	P58417	271 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	12.73	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	GNA12	Q03113	381 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	SCAP	Q12770	1279 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	C3orf20	Q8ND61	904 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	SAP25	Q8TEE9	199 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	NTAN1	Q96AB6	310 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PDE4A-208	ENST00000591971	SERAC1	Q96JX3	654 aa		12.73	□□□□□ -0.37

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