RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584582.5

TOP3A-217, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

TSL 5

Gene TOP3A, Length 3,661 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-217ENST00000584582 HMCESQ96FZ2 354 aa11.46□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 SERPINB11Q96P15 392 aa11.46□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 COG4Q9H9E3 785 aa11.46□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 GLOD4Q9HC38 313 aa11.46□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 GKN1Q9NS71 199 aa11.46□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 RNF186Q9NXI6 227 aa11.46□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 TRHDEQ9UKU6 1024 aa11.46□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 DSEQ9UL01 958 aa11.46□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 ENO4A6NNW6 628 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 SUPT3HB4E1H0 165 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 SUPT3HO75486 399 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 NDUFS3O75489 264 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 HOXD10P28358 340 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 RPL9P32969 192 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 CRHR1P34998 444 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 AP2B1P63010 937 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 GRIK3Q13003 919 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 WDR60Q8WVS4 1066 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 TEKT5Q96M29 485 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 POMKQ9H5K3 350 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 ARHGEF3Q9NR81 526 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 TRIM17Q9Y577 477 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 ACTL7AQ9Y615 435 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 BRCA2P51587 3418 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 DDHD2O94830 711 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 RHOBTB1O94844 696 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 RENBPP51606 427 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 PLD1Q13393 1074 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 UPP1Q16831 310 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 CNSTQ6PJW8 725 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 AUTS2Q8WXX7 1259 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 ACBD6Q9BR61 282 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 C20orf27Q9GZN8 174 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 CCSER2Q9H7U1 834 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 KCNK4Q9NYG8 393 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 HACD3Q9P035 362 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 MID2Q9UJV3 735 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 A0A0U1RQF3 1178 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 H0Y626 953 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 SMIM24O75264 130 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 HLA-DQB2P05538 268 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 RAB27AP51159 221 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 KCNQ1P51787 676 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 TAS2R39P59534 338 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 FAM156AQ8NDB6 213 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 TBATAQ96M53 351 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 HBEGFQ99075 208 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 ZBED2Q9BTP6 218 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 BRD8Q9H0E9 1235 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 DCLRE1BQ9H816 532 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 CDYLQ9Y232 598 aa11.45□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 FAM159BA6NKW6 160 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 KPNA6O60684 536 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 KLHL2O95198 593 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 FYNP06241 537 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 ACLYP53396 1101 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 RPS24P62847 133 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 TMEM154Q6P9G4 183 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 TPGS1Q6ZTW0 290 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 TMPRSS6Q8IU80 811 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 CMTM5Q96DZ9 223 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 GBP5Q96PP8 586 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 GBA3Q9H227 469 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 LRMDAQ9H2I8 198 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 ATP13A1Q9HD20 1204 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 AURKAO14965 403 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 CKMP06732 381 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 GRK2P25098 689 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 FMO4P31512 558 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 NPY2RP49146 381 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 ALFQ53S48 1182 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 PCID2Q5JVF3 399 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 MORN1Q5T089 497 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 IZUMO2Q6UXV1 221 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 CYP2R1Q6VVX0 501 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 SLC24A5Q71RS6 500 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 HPS6Q86YV9 775 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 ICA1LQ8NDH6 482 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 LRGUKQ96M69 825 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 CDRT15Q96T59 188 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 TRIM62Q9BVG3 475 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 APOL5Q9BWW9 433 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 RGS18Q9NS28 235 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 TBC1D13Q9NVG8 400 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 AURKCQ9UQB9 309 aa11.44□□□□□ -0.58
TOP3A-217ENST00000584582 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms