RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583514.5

LLGL2-221, Transcript of LLGL2, scribble cell polarity complex component, human

TSL 3

Gene LLGL2, Length 409 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LLGL2-221	ENST00000583514	F9	P00740	461 aa		15.91	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	RRM1	P23921	792 aa		15.91	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	FLT3	P36888	993 aa		15.91	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	15.91	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		15.91	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	DHRS13	Q6UX07	377 aa		15.91	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	LRRC31	Q6UY01	552 aa		15.91	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		15.91	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	15.91	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		15.91	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	EID2	Q8N6I1	236 aa		15.91	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		15.91	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	C1orf74	Q96LT6	269 aa		15.91	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	15.91	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		15.91	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	VPS51	Q9UID3	782 aa		15.91	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	TRABD2B	A6NFA1	517 aa		15.9	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	ENC1	O14682	589 aa		15.9	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	YKT6	O15498	198 aa		15.9	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	15.9	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	AKR1B10	O60218	316 aa		15.9	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	SRGAP2	O75044	1071 aa		15.9	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	15.9	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	CTSL	P07711	333 aa		15.9	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	15.9	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	SCNN1A	P37088	669 aa		15.9	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	15.9	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	VAV2	P52735	878 aa		15.9	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	BNIP3	Q12983	259 aa		15.9	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	DNAJC3	Q13217	504 aa		15.9	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	15.9	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		15.9	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	LINGO4	Q6UY18	593 aa		15.9	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		15.9	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	15.9	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	TRIM69	Q86WT6	500 aa		15.9	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	SPATS2	Q86XZ4	545 aa	Known RBP	15.9	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		15.9	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		15.9	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	15.9	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	DMTF1	Q9Y222	760 aa		15.9	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		15.9	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	15.9	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		15.9	■□□□□ 0.14
LLGL2-221	ENST00000583514		E9PAM4	449 aa		15.89	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514		F8VZ95	297 aa		15.89	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	15.89	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	PJA2	O43164	708 aa		15.89	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	15.89	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	MME	P08473	750 aa		15.89	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	OR1E1	P30953	314 aa		15.89	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	CHRNA3	P32297	505 aa		15.89	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	SOX5	P35711	763 aa		15.89	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	NUDT1	P36639	197 aa		15.89	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	TAS2R38	P59533	333 aa		15.89	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	KIF5A	Q12840	1032 aa		15.89	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	STAT4	Q14765	748 aa		15.89	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	SLC18A3	Q16572	532 aa		15.89	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	15.89	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		15.89	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		15.89	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	TRNP1	Q6NT89	227 aa		15.89	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	KIAA1328	Q86T90	577 aa		15.89	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	IQCH	Q86VS3	1027 aa		15.89	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		15.89	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	CCDC114	Q96M63	670 aa		15.89	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		15.89	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	DESI2	Q9BSY9	194 aa		15.89	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		15.89	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	PREB	Q9HCU5	417 aa		15.89	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		15.89	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	RAX	Q9Y2V3	346 aa		15.89	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		15.89	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		15.89	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		15.88	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		15.88	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	RNF103	O00237	685 aa		15.88	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	15.88	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	ENDOD1	O94919	500 aa		15.88	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	GLDC	P23378	1020 aa		15.88	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	RXRG	P48443	463 aa		15.88	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	CYP4F3	Q08477	520 aa		15.88	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	CAMK2B	Q13554	666 aa		15.88	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	15.88	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	ARTN	Q5T4W7	220 aa		15.88	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	15.88	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	NAA35	Q5VZE5	725 aa		15.88	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	FAM131B	Q86XD5	332 aa		15.88	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	OXR1	Q8N573	874 aa		15.88	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	15.88	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		15.88	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	CHST14	Q8NCH0	376 aa		15.88	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		15.88	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	TMIE	Q8NEW7	156 aa		15.88	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	OR7D4	Q8NG98	312 aa		15.88	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		15.88	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		15.88	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	KLK6	Q92876	244 aa		15.88	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	ARRDC3	Q96B67	414 aa		15.88	■□□□□ 0.13
LLGL2-221	ENST00000583514	HAPLN3	Q96S86	360 aa		15.88	■□□□□ 0.13

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