RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-206	ENST00000578093	LY6D	Q14210	128 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	KCNJ12	Q14500	433 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	RTP5	Q14D33	572 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TCEAL1	Q15170	157 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CHST9	Q7L1S5	443 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF605	Q86T29	641 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	DENND1C	Q8IV53	801 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	EID2	Q8N6I1	236 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SAP25	Q8TEE9	199 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	DHX58	Q96C10	678 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TNIP3	Q96KP6	325 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093		Q96M66	194 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	NUP58	Q9BVL2	599 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TNMD	Q9H2S6	317 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TMEM245	Q9H330	911 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	COMMD8	Q9NX08	183 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	KIF3A	Q9Y496	699 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	UBE4B	O95155	1302 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SPTA1	P02549	2419 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093		A0A1W2PR77	199 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SLC12A8	A0AV02	714 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093		E9PAM4	449 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093		J3QKU1	62 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	NPC1	O15118	1278 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	VILL	O15195	856 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	MID1	O15344	667 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	KLF4	O43474	513 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SDC3	O75056	442 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	KIF20A	O95235	890 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	HLA-DRA	P01903	254 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	DNTT	P04053	509 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	FAM163B	P0C2L3	166 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TRIM49	P0CI25	452 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TRIM49C	P0CI26	452 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	JUP	P14923	745 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CD58	P19256	250 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	SSTR4	P31391	388 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	PIK3CA	P42336	1068 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF132	P52740	706 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	GALC	P54803	685 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	INCA1	Q0VD86	236 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	CUL4B	Q13620	913 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	RABEP1	Q15276	862 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ZACN	Q401N2	412 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PTPRM-206	ENST00000578093	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		4.1	□□□□□ -1.75

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