RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563261.5

SNAI3-AS1-201, SNAI3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAI3-AS1, Length 998 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KIAA1328Q86T90 577 aa22.56■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa22.56■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PIGKQ92643 395 aa22.56■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa22.56■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NEUROG2Q9H2A3 272 aa22.56■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 WASF2Q9Y6W5 498 aa22.56■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa22.55■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LRRD1A4D1F6 860 aa22.55■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.55■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 METTL12A8MUP2 240 aa22.55■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 J3KR12 359 aa22.55■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PSTPIP1O43586 416 aa22.55■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IGSF6O95976 241 aa22.55■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF806P0C7X5 589 aa22.55■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ITPKAP23677 461 aa22.55■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KDELR1P24390 212 aa22.55■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RHOAP61586 193 aa22.55■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 WDR45BQ5MNZ6 344 aa22.55■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC112Q8NEF3 446 aa22.55■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TPCN2Q8NHX9 752 aa22.55■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PCDH19Q8TAB3 1148 aa22.55■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RAPGEF5Q92565 580 aa22.55■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PPP1R16AQ96I34 528 aa22.55■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LRIG1Q96JA1 1093 aa22.55■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DYRK4Q9NR20 520 aa22.55■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HYOU1Q9Y4L1 999 aa22.55■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ALG6Q9Y672 507 aa22.55■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SDK1Q7Z5N4 2213 aa22.54■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LRRC72A6NJI9 287 aa22.54■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LEFTY1O75610 366 aa22.54■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KRT1P04264 644 aa22.54■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 METAP1P53582 386 aa22.54■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ADPRHP54922 357 aa22.54■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC15Q0P6D6 951 aa22.54■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ODF2Q5BJF6 829 aa22.54■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ARSIQ5FYB1 569 aa22.54■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa22.54■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRR23CQ6ZRP0 262 aa22.54■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RABEPKQ7Z6M1 372 aa22.54■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ATPAF2Q8N5M1 289 aa22.54■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NETO2Q8NC67 525 aa22.54■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OR2T34Q8NGX1 318 aa22.54■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF599Q96NL3 588 aa22.54■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa22.54■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LHX3Q9UBR4 397 aa22.54■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SALL4Q9UJQ4 1053 aa22.54■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PILRBQ9UKJ0 227 aa22.54■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MFSD11O43934 449 aa22.53■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 POP4O95707 220 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LMNB2Q03252 620 aa22.53■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RAD51Q06609 339 aa22.53■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CNTN1Q12860 1018 aa22.53■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CYTH1Q15438 398 aa22.53■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCDC6Q16204 474 aa22.53■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 POM121L1PQ3SYA9 428 aa22.53■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AGBL4Q5VU57 503 aa22.53■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DCAF12L1Q5VU92 463 aa22.53■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa22.53■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DAAM2Q86T65 1068 aa22.53■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LRRC49Q8IUZ0 686 aa22.53■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TP53INP2Q8IXH6 220 aa22.53■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KIAA2013Q8IYS2 634 aa22.53■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RGL4Q8IZJ4 473 aa22.53■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DNASE2BQ8WZ79 361 aa22.53■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RNF157Q96PX1 679 aa22.53■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DESI2Q9BSY9 194 aa22.53■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LACRTQ9GZZ8 138 aa22.53■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KDM4CQ9H3R0 1056 aa22.53■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GOLPH3Q9H4A6 298 aa22.53■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SUSD2Q9UGT4 822 aa22.53■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NUMA1Q14980 2115 aa22.52■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DMDP11532 3685 aa22.52■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PALMO75781 387 aa22.52■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ITGB7P26010 798 aa22.52■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KIF5AQ12840 1032 aa22.52■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MYLK3Q32MK0 819 aa22.52■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMCO4Q5TGY1 634 aa22.52■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KIAA0895LQ68EN5 471 aa22.52■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NCEH1Q6PIU2 408 aa22.52■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OR6K2Q8NGY2 324 aa22.52■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OR14C36Q8NHC7 312 aa22.52■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ARRDC3Q96B67 414 aa22.52■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa22.52■■□□□ 1.2
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMEM74BQ9NUR3 256 aa22.52■■□□□ 1.2
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