RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 ZXDBP98169 803 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 KRT81Q14533 505 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 DHCR24Q15392 516 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 CCDC142Q17RM4 750 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 BEND5Q7L4P6 421 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 DEFB106AQ8N104 65 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 ACTL9Q8TC94 416 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 HSPA12BQ96MM6 686 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 CALN1Q9BXU9 219 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 POPDC2Q9HBU9 364 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 PCDH9Q9HC56 1237 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 ARHGEF4Q9NR80 690 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 PLAAQ9Y263 795 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 RAI2Q9Y5P3 530 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 NFS1Q9Y697 457 aa20.46■□□□□ 0.87
CTDSP2-204ENST00000548823 MYOFQ9NZM1 2061 aa20.45■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa20.45■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 LEFTY2O00292 366 aa20.45■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF217O75362 1048 aa20.45■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 NUDT17P0C025 328 aa20.45■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 PFKLP17858 780 aa20.45■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 ADCY8P40145 1251 aa20.45■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 PMS2P54278 862 aa20.45■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 AIF1P55008 147 aa20.45■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 RAB6CQ53S08 254 aa20.45■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC9A4Q6AI14 798 aa20.45■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 PM20D1Q6GTS8 502 aa20.45■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 SCYL2Q6P3W7 929 aa20.45■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 C4orf50Q6ZRC1 276 aa20.45■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 GSTA5Q7RTV2 222 aa20.45■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 TRIM62Q9BVG3 475 aa20.45■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 RAB6CQ9H0N0 254 aa20.45■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 ANAPC5Q9UJX4 755 aa20.45■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 TENM4Q6N022 2769 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 GNSP15586 552 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 IL4RP24394 825 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 NOMO1Q15155 1222 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 C12orf40Q86WS4 652 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 RELL1Q8IUW5 271 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 RGL4Q8IZJ4 473 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 GALNT15Q8N3T1 639 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 KCNV2Q8TDN2 545 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM149B1Q96BN6 582 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 ULBP1Q9BZM6 244 aa20.44■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 MCF2LO15068 1137 aa20.43■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 DKK1O94907 266 aa20.43■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 STIP1P31948 543 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 L1CAMP32004 1257 aa20.43■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 SULT1E1P49888 294 aa20.43■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 ITGA8P53708 1063 aa20.43■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 GRIK2Q13002 908 aa20.43■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 CAMK2BQ13554 666 aa20.43■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa20.43■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 SYCP2LQ5T4T6 812 aa20.43■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 CROCCP2Q86T23 111 aa20.43■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 TMEM51Q9NW97 253 aa20.43■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 TOR4AQ9NXH8 423 aa20.43■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa20.43■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 USP3Q9Y6I4 520 aa20.43■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 SMAPO00193 183 aa20.42■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 APOL1O14791 398 aa20.42■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 ZBED1O96006 694 aa20.42■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 PCGF5Q86SE9 256 aa20.42■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 P3H4Q92791 437 aa20.42■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 NTAN1Q96AB6 310 aa20.42■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 KCNK16Q96T55 309 aa20.42■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 FAM118BQ9BPY3 351 aa20.42■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 TMEM30AQ9NV96 361 aa20.42■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 FZD10Q9ULW2 581 aa20.42■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 AP4E1Q9UPM8 1137 aa20.42■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 CFAP69A5D8W1 941 aa20.41■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 ADH1CP00326 375 aa20.41■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 F9P00740 461 aa20.41■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 LTFP02788 710 aa20.41■□□□□ 0.86
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF883P0CG24 379 aa20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms