RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533235.5

SLC43A3-223, Transcript of solute carrier family 43 member 3, human

TSL 5

Gene SLC43A3, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC43A3-223	ENST00000533235	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SLC43A3-223	ENST00000533235	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
SLC43A3-223	ENST00000533235	MYO6	Q9UM54	1294 aa		14.72	□□□□□ -0.05
SLC43A3-223	ENST00000533235	ZZEF1	O43149	2961 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SLC43A3-223	ENST00000533235	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SLC43A3-223	ENST00000533235		A0A1W2PQU0	124 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SLC43A3-223	ENST00000533235	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SLC43A3-223	ENST00000533235	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SLC43A3-223	ENST00000533235	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
SLC43A3-223	ENST00000533235	RAMP2	O60895	175 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SLC43A3-223	ENST00000533235	ITGB7	P26010	798 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SLC43A3-223	ENST00000533235	ZNF165	P49910	485 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SLC43A3-223	ENST00000533235	SLC20A2	Q08357	652 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SLC43A3-223	ENST00000533235	ZNF284	Q2VY69	593 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SLC43A3-223	ENST00000533235	INAVA	Q3KP66	663 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SLC43A3-223	ENST00000533235	CARD16	Q5EG05	197 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SLC43A3-223	ENST00000533235	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SLC43A3-223	ENST00000533235	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SLC43A3-223	ENST00000533235	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
SLC43A3-223	ENST00000533235	IQCH	Q86VS3	1027 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SLC43A3-223	ENST00000533235	HORMAD1	Q86X24	394 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SLC43A3-223	ENST00000533235	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SLC43A3-223	ENST00000533235	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
SLC43A3-223	ENST00000533235	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SLC43A3-223	ENST00000533235	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
SLC43A3-223	ENST00000533235	KLK6	Q92876	244 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SLC43A3-223	ENST00000533235	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SLC43A3-223	ENST00000533235	HDAC8	Q9BY41	377 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SLC43A3-223	ENST00000533235	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SLC43A3-223	ENST00000533235	MAGEH1	Q9H213	219 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SLC43A3-223	ENST00000533235	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SLC43A3-223	ENST00000533235	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SLC43A3-223	ENST00000533235	FZD3	Q9NPG1	666 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SLC43A3-223	ENST00000533235	DYRK4	Q9NR20	520 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SLC43A3-223	ENST00000533235	FZD10	Q9ULW2	581 aa		14.71	□□□□□ -0.05
SLC43A3-223	ENST00000533235	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
SLC43A3-223	ENST00000533235	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	MYLK	Q15746	1914 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235		A0A1B0GTH6	734 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	SMTNL1	A8MU46	457 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	YKT6	O15498	198 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	TNFSF14	O43557	240 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	CCDC172	P0C7W6	258 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	ADRB3	P13945	408 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	L1CAM	P32004	1257 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	GK	P32189	559 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	DNA2	P51530	1060 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	NEK3	P51956	506 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	IQCB1	Q15051	598 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	EFHC2	Q5JST6	749 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	NEK5	Q6P3R8	708 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	CNPY3	Q9BT09	278 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	KLC2	Q9H0B6	622 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235		A0A1W2PQC6	194 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	ANKRD62	A6NC57	917 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	SLC31A1	O15431	190 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	ITGAV	P06756	1048 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	EPHB2	P29323	1055 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	ABL2	P42684	1182 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	OVGP1	Q12889	678 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	STAT4	Q14765	748 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	ASIC2	Q16515	512 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	TMC6	Q7Z403	805 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	OXR1	Q8N573	874 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	CHD6	Q8TD26	2715 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	SPINT1	O43278	529 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	KDELR3	O43731	214 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	CREB3	O43889	395 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	TMCC1	O94876	653 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	PCDH8	O95206	1070 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	GSR	P00390	522 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	CAPNS1	P04632	268 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	TNFAIP3	P21580	790 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	PRKCI	P41743	596 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	RXRG	P48443	463 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SLC43A3-223	ENST00000533235	AIF1	P55008	147 aa		14.68	□□□□□ -0.06

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