RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 FAM184AQ8NB25 1140 aa4.56□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 VN1R2Q8NFZ6 395 aa4.56□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 GPR150Q8NGU9 434 aa4.56□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 SUSD6Q92537 303 aa4.56□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 GTF3C6Q969F1 213 aa4.56□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 AK8Q96MA6 479 aa4.56□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 RPS6KC1Q96S38 1066 aa4.56□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 LXNQ9BS40 222 aa4.56□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 CERS4Q9HA82 394 aa4.56□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 GPR35Q9HC97 309 aa4.56□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 TAGLN3Q9UI15 199 aa4.56□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 PACSIN3Q9UKS6 424 aa4.56□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 CORO2BQ9UQ03 480 aa4.56□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 GINS2Q9Y248 185 aa4.56□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 MED16Q9Y2X0 877 aa4.56□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 VCANP13611 3396 aa4.56□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 EVPLQ92817 2033 aa4.56□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 XIRP2A4UGR9 3374 aa4.56□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 CLUHO75153 1309 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 A0A1W2PPL8 197 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 EPOPA6NHQ4 379 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 AHRRA9YTQ3 701 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 NCAM2O15394 837 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 HAUS5O94927 633 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 NUDT3O95989 172 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 GLUD1P00367 558 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 VTNP04004 478 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 LINC00271P0C7V0 271 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 NR4A1P22736 598 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 RPA1P27694 616 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 NRIP1P48552 1158 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 GLUD2P49448 558 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 PTENP60484 403 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 TFF2Q03403 129 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 SMARCB1Q12824 385 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 TCF15Q12870 199 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 PLD1Q13393 1074 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 KCNC3Q14003 757 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 EMC2Q15006 297 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 LONRF1Q17RB8 773 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 USP41Q3LFD5 358 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 RILPL1Q5EBL4 403 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 XKR9Q5GH70 373 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 LY6G5CQ5SRR4 150 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 LIN9Q5TKA1 542 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 RHPN2Q8IUC4 686 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 VRK3Q8IV63 474 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 CD302Q8IX05 232 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC26Q8TAB7 109 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 CYP2W1Q8TAV3 490 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 TBC1D15Q8TC07 691 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 IGSF21Q96ID5 467 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 CASD1Q96PB1 797 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 NELL2Q99435 816 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 MLST8Q9BVC4 326 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 LRRC2Q9BYS8 371 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 GPR88Q9GZN0 384 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 EPC1Q9H2F5 836 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 UNC45AQ9H3U1 944 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 BRD9Q9H8M2 597 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 GJB4Q9NTQ9 266 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 VPS54Q9P1Q0 977 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 TPCN1Q9ULQ1 816 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 CHST2Q9Y4C5 530 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 ARID2Q68CP9 1835 aa4.55□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 REV3LO60673 3130 aa4.54□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 A0A087WZ62 844 aa4.54□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 ARHGEF35A5YM69 484 aa4.54□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF785A8K8V0 405 aa4.54□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa4.54□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 H7C4K7 107 aa4.54□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF197O14709 1029 aa4.54□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 CHMP2AO43633 222 aa4.54□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP4.54□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 TBX10O75333 385 aa4.54□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 KIF20AO95235 890 aa4.54□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 OR52Z1P0C646 297 aa4.54□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 GLULP15104 373 aa4.54□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 TSHRP16473 764 aa4.54□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
HDAC2-216ENST00000523628 GCSHP23434 173 aa4.54□□□□□ -1.68
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