RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520064.2

LARP4-208, Transcript of La ribonucleoprotein domain family member 4, human

TSL 5

Gene LARP4, Length 2,068 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LARP4-208	ENST00000520064	MZB1	Q8WU39	189 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	DACH2	Q96NX9	599 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	CDK19	Q9BWU1	502 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	10.79	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	TINAG	Q9UJW2	476 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	ALG6	Q9Y672	507 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	TNR	Q92752	1358 aa		10.79	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064		F8W036	122 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	KCNQ3	O43525	872 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	PPM1B	O75688	479 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	MICAL2	O94851	1124 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	PIGN	O95427	931 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	WDPCP	O95876	746 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	CYP11B1	P15538	503 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	MX2	P20592	715 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	KEL	P23276	732 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	GRIA1	P42261	906 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	PTPN5	P54829	565 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	ZNF773	Q6PK81	442 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	WDR48	Q8TAF3	677 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	ARL5B	Q96KC2	179 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	ZHX3	Q9H4I2	956 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	CD320	Q9NPF0	282 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	IFT46	Q9NQC8	304 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	GINS2	Q9Y248	185 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	RREB1	Q92766	1687 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064		A0A0B4J269	797 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	E2F3	O00716	465 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	PLD2	O14939	933 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	PRKAB2	O43741	272 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	GREM1	O60565	184 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	UGT2B11	O75310	529 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	APOC1	P02654	83 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	UCHL3	P15374	230 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	10.78	□□□□□ -0.68	6e-10	■□□□□ 8.9
LARP4-208	ENST00000520064	CYP2C18	P33260	490 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	MCM7	P33993	719 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	GRK3	P35626	688 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	TPMT	P51580	245 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	TUBB3	Q13509	450 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	DGUOK	Q16854	277 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064		Q5BKY6	102 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	STK32C	Q86UX6	486 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	STX12	Q86Y82	276 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	UFD1	Q92890	307 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	SHISA4	Q96DD7	197 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	CSF3R	Q99062	836 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	C12orf57	Q99622	126 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	POLE3	Q9NRF9	147 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	PLLP	Q9Y342	182 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	ATRN	O75882	1429 aa		10.78	□□□□□ -0.68
LARP4-208	ENST00000520064	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LARP4-208	ENST00000520064	FSCN2	O14926	492 aa		10.77	□□□□□ -0.69
LARP4-208	ENST00000520064	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
LARP4-208	ENST00000520064	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69

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