RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514384.1

SMIM20-202, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SMIM20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-202ENST00000514384 CST8O60676 142 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 LRCH4O75427 683 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 MAFO75444 373 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 PENKP01210 267 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 LYNP07948 512 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 PDHA1P08559 390 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 SPATA31D3P0C874 917 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 MYL2P10916 166 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 ANPEPP15144 967 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 TCF4P15884 667 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 CRHR1P34998 444 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 PEX19P40855 299 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 MAGEA3P43357 314 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 ABCG1P45844 678 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 RPS6KA3P51812 740 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 EFNA5P52803 228 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 SP2Q02086 613 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 DSG1Q02413 1049 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 CREB5Q02930 508 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 CUL3Q13618 768 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 ITGA9Q13797 1035 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 GRM2Q14416 872 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 EMC2Q15006 297 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 LLGL1Q15334 1064 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 C4orf17Q53FE4 359 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 KAZNQ674X7 775 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 PGM2L1Q6PCE3 622 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 MARCH9Q86YJ5 346 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 TMEM126BQ8IUX1 230 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 SCUBE1Q8IWY4 988 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 WDTC1Q8N5D0 677 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 PNPLA1Q8N8W4 532 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 WDR60Q8WVS4 1066 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 E2F7Q96AV8 911 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 MCRS1Q96EZ8 462 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 SERAC1Q96JX3 654 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 CASD1Q96PB1 797 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 MCEEQ96PE7 176 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 GBP5Q96PP8 586 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 BTBD9Q96Q07 612 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 ADAM2Q99965 735 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 FAM118BQ9BPY3 351 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 ECSITQ9BQ95 431 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 CENPKQ9BS16 269 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 CCDC106Q9BWC9 280 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 SEMA4CQ9C0C4 833 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 NMUR2Q9GZQ4 415 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 PIDD1Q9HB75 910 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 NDE1Q9NXR1 346 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 ANKMY1Q9P2S6 941 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 DCTN4Q9UJW0 460 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 ITGA11Q9UKX5 1188 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 TTLL3Q9Y4R7 772 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 ITPR3Q14573 2671 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 NOTCH2Q04721 2471 aa7.36□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 CACNA1EQ15878 2313 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 A0A087WV48 116 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 TMEM150BA6NC51 233 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 SDR42E2A6NKP2 422 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 FAM159BA6NKW6 160 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 K7ERI5 159 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 HGSO14964 777 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 BUD23O43709 281 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 GAS2O43903 313 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 RFPL1O75677 317 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 RPP40O75818 363 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 CALCAP01258 141 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 IFNB1P01574 187 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 BPGMP07738 259 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 CNPP09543 421 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 CTSAP10619 480 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 KRT3P12035 628 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 CCDC130P13994 396 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 TPSB2P20231 275 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 BGNP21810 368 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 TGM2P21980 687 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 PSMA2P25787 234 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 CDC25CP30307 473 aa7.35□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 CPOXP36551 454 aa7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms