RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513573.1

CDH18-AS1-201, CDH18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH18-AS1, Length 424 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RNF34Q969K3 372 aa20.52■□□□□ 0.88
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SGF29Q96ES7 293 aa20.52■□□□□ 0.88
CDH18-AS1-201ENST00000513573 KREMEN1Q96MU8 473 aa20.52■□□□□ 0.88
CDH18-AS1-201ENST00000513573 IL12RB2Q99665 862 aa20.52■□□□□ 0.88
CDH18-AS1-201ENST00000513573 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DYRK4Q9NR20 520 aa20.52■□□□□ 0.88
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ASNSD1Q9NWL6 643 aa20.52■□□□□ 0.88
CDH18-AS1-201ENST00000513573 IL36AQ9UHA7 158 aa20.52■□□□□ 0.88
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa20.51■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LMO7DNF2Z398 122 aa20.51■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 P4HA2O15460 535 aa20.51■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LEFTY1O75610 366 aa20.51■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CNTN5O94779 1100 aa20.51■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GJB6O95452 261 aa20.51■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 AFPP02771 609 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ADRB3P13945 408 aa20.51■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RRM1P23921 792 aa20.51■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SLC5A2P31639 672 aa20.51■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NEK3P51956 506 aa20.51■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 INHBCP55103 352 aa20.51■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa20.51■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CRTC1Q6UUV9 634 aa20.51■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa20.51■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ARHGEF19Q8IW93 802 aa20.51■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DEFB106AQ8N104 65 aa20.51■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SNX21Q969T3 373 aa20.51■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 VOPP1Q96AW1 172 aa20.51■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DDIT4Q9NX09 232 aa20.51■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa20.51■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LRRK2Q5S007 2527 aa20.5■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PLD2O14939 933 aa20.5■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MUSKO15146 869 aa20.5■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SFTPCP11686 197 aa20.5■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ITGB7P26010 798 aa20.5■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 L1CAMP32004 1257 aa20.5■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RPIAP49247 311 aa20.5■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CDK17Q00537 523 aa20.5■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LRRC63Q05C16 580 aa20.5■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RRAGAQ7L523 313 aa20.5■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 WDTC1Q8N5D0 677 aa20.5■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DCAF4L2Q8NA75 395 aa20.5■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DENND6BQ8NEG7 585 aa20.5■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LMX1AQ8TE12 382 aa20.5■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZNF606Q8WXB4 792 aa20.5■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 EXTL1Q92935 676 aa20.5■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PPP1R16AQ96I34 528 aa20.5■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CCDC3Q9BQI4 270 aa20.5■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SPASTQ9UBP0 616 aa20.5■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 A0A1W2PQ27 194 aa20.49■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 A0A1W2PQ64 194 aa20.49■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 DRGXA6NNA5 263 aa20.49■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 I6L893 689 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FPGTO14772 594 aa20.49■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NVLO15381 856 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PAGE1O75459 146 aa20.49■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZNF202O95125 648 aa20.49■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 UGT1A5P35504 534 aa20.49■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TGIF1Q15583 401 aa20.49■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ALFQ53S48 1182 aa20.49■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 C22orf39Q6P5X5 142 aa20.49■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FOXR1Q6PIV2 292 aa20.49■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 USP53Q70EK8 1073 aa20.49■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SPATA20Q8TB22 786 aa20.49■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GLMNQ92990 594 aa20.49■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CENPTQ96BT3 561 aa20.49■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CLPBQ9H078 707 aa20.49■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MUC3BQ9H195 1237 aa20.49■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa20.49■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 FAM204AQ9H8W3 233 aa20.49■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SCN8AQ9UQD0 1980 aa20.48■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 A0A0D9SEW6 157 aa20.48■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 YY2O15391 372 aa20.48■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZMPSTE24O75844 475 aa20.48■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NTRK1P04629 796 aa20.48■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 NFKB2Q00653 900 aa20.48■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PDCLQ13371 301 aa20.48■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SPIDRQ14159 915 aa20.48■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa20.48■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 RBFAQ8N0V3 343 aa20.48■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 EHBP1Q8NDI1 1231 aa20.48■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa20.48■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 SPATA32Q96LK8 384 aa20.48■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TSG101Q99816 390 aa20.48■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 CEP44Q9C0F1 390 aa20.48■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ANLNQ9NQW6 1124 aa20.48■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 ZNF212Q9UDV6 495 aa20.48■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 PADI4Q9UM07 663 aa20.48■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TRIM49BA6NDI0 452 aa20.47■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa20.47■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 TSPAN6O43657 245 aa20.47■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 HSF2BPO75031 334 aa20.47■□□□□ 0.87
CDH18-AS1-201ENST00000513573 LIPCP11150 499 aa20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms