RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1W2PPC4 97 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNK5O95279 499 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 WNT1P04628 370 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 SERINC3Q13530 473 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 DPYSQ14117 519 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC18A3Q16572 532 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 CARD16Q5EG05 197 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 NIPA2Q8N8Q9 360 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 DEFB124Q8NES8 71 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 TMIEQ8NEW7 156 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 OR8K1Q8NGG5 319 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 HSPH1Q92598 858 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 EXOC2Q96KP1 924 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 RBSNQ9H1K0 784 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 PDFQ9HBH1 243 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP19.04■□□□□ 0.643e-7■□□□□ 9.2
SH3BP2-218ENST00000511185 SPTLC3Q9NUV7 552 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 TBC1D3EA0A087X179 549 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 TBC1D3LB9A6J9 549 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC7A4O43246 635 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 BUB1O43683 1085 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 OPHN1O60890 802 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 PRNPP04156 253 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 SYPP08247 313 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 TBC1D3HP0C7X1 549 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 ERCC2P18074 760 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 PCK1P35558 622 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 GRIA4P48058 902 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 DPYSL2Q16555 572 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 KIF19Q2TAC6 998 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 PARP15Q460N3 678 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 SARM1Q6SZW1 724 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC39A8Q9C0K1 460 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 ETNK2Q9NVF9 386 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP19.03■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 LHX3Q9UBR4 397 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 HPCAL4Q9UM19 191 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 CA5BQ9Y2D0 317 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 SNX11Q9Y5W9 270 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 LRP4O75096 1905 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 J3KR12 359 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 LATO43561 262 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 GSRP00390 522 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 RARAP10276 462 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 CD59P13987 128 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 HTR7P34969 479 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 GJC1P36383 396 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 CCR5P51681 352 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC20A2Q08357 652 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 LRRC73Q5JTD7 316 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 AFMIDQ63HM1 303 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 OR2AP1Q8NGE2 309 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 MYOCQ99972 504 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 HEPHQ9BQS7 1158 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 DEF6Q9H4E7 631 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 GAREM1Q9H706 876 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 OSGEPQ9NPF4 335 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 KLHL11Q9NVR0 708 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 GGT7Q9UJ14 662 aa19.02■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
SH3BP2-218ENST00000511185 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNK3O14649 394 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 SPINT1O43278 529 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 CD48P09326 243 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 ITGB7P26010 798 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 ABL2P42684 1182 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 HLA-BQ31612 363 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 PIP4P1Q86T03 277 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM69Q86WT6 500 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 GAS2L3Q86XJ1 694 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 KLK6Q92876 244 aa19.01■□□□□ 0.63
SH3BP2-218ENST00000511185 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms