RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508242.1

MRPS35P2-201, Transcript of mitochondrial ribosomal protein S35 pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene MRPS35P2, Length 191 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS35P2-201ENST00000508242 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
MRPS35P2-201ENST00000508242 NCAPH2Q6IBW4 605 aa2.28□□□□□ -2.04
MRPS35P2-201ENST00000508242 WDR5BQ86VZ2 330 aa2.28□□□□□ -2.04
MRPS35P2-201ENST00000508242 KBTBD3Q8NAB2 608 aa2.28□□□□□ -2.04
MRPS35P2-201ENST00000508242 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa2.28□□□□□ -2.04
MRPS35P2-201ENST00000508242 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
MRPS35P2-201ENST00000508242 DCTN5Q9BTE1 182 aa2.28□□□□□ -2.04
MRPS35P2-201ENST00000508242 IFT27Q9BW83 186 aa2.28□□□□□ -2.04
MRPS35P2-201ENST00000508242 LHPPQ9H008 270 aa2.28□□□□□ -2.04
MRPS35P2-201ENST00000508242 LRFN1Q9P244 771 aa2.28□□□□□ -2.04
MRPS35P2-201ENST00000508242 POU2F3Q9UKI9 436 aa2.28□□□□□ -2.04
MRPS35P2-201ENST00000508242 OSGIN2Q9Y236 505 aa2.28□□□□□ -2.04
MRPS35P2-201ENST00000508242 A0A0A0MQY5 61 aa2.27□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 SLC38A8A6NNN8 435 aa2.27□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 VSTM5A8MXK1 200 aa2.27□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 KRTAP5-8O75690 187 aa2.27□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 DDAH2O95865 285 aa2.27□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 PRPH2P23942 346 aa2.27□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 MARK3P27448 753 aa2.27□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 STT3AP46977 705 aa2.27□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 ANAPC15P60006 121 aa2.27□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 ZBTB17Q13105 803 aa2.27□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 KRT72Q14CN4 511 aa2.27□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 ZNF569Q5MCW4 686 aa2.27□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 FAM69BQ5VUD6 431 aa2.27□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa2.27□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 KLHL24Q6TFL4 600 aa2.27□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 SLC26A9Q7LBE3 791 aa2.27□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 TRIM74Q86UV6 250 aa2.27□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 TRIM73Q86UV7 250 aa2.27□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 TMC8Q8IU68 726 aa2.27□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 SPAG16Q8N0X2 631 aa2.27□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 ZNF441Q8N8Z8 693 aa2.27□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 OR1N1Q8NGS0 311 aa2.27□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 FAM76AQ8TAV0 307 aa2.27□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 GPT2Q8TD30 523 aa2.27□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 MSTO1Q9BUK6 570 aa2.27□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 HDHD5Q9BXW7 423 aa2.27□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa2.27□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 EPS8L2Q9H6S3 715 aa2.27□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 NECTIN3Q9NQS3 549 aa2.27□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 TMEM51Q9NW97 253 aa2.27□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa2.27□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 SLC25A13Q9UJS0 675 aa2.27□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa2.26□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 KIF28PB7ZC32 967 aa2.26□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 RASA4BC9J798 803 aa2.26□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 LARGE1O95461 756 aa2.26□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 FCGR2AP12318 317 aa2.26□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 SLC5A1P13866 664 aa2.26□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 GSTM2P28161 218 aa2.26□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 ALDH4A1P30038 563 aa2.26□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 SSTR2P30874 369 aa2.26□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 DCTDP32321 178 aa2.26□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 RCAN1P53805 252 aa2.26□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP2.26□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 PPP2R5AQ15172 486 aa2.26□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 SYT16Q17RD7 645 aa2.26□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa2.26□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 ZNF497Q6ZNH5 498 aa2.26□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 TXLNBQ8N3L3 684 aa2.26□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 AADATQ8N5Z0 425 aa2.26□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 MECRQ9BV79 373 aa2.26□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP2.26□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 ZNF224Q9NZL3 707 aa2.26□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 PAM16Q9Y3D7 125 aa2.26□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa2.25□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 C16orf97H3BN30 126 aa2.25□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 CHL1O00533 1208 aa2.25□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 KDM4BO94953 1096 aa2.25□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 LINC00271P0C7V0 271 aa2.25□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 MCM3P25205 808 aa2.25□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 KLRK1P26718 216 aa2.25□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 LIFRP42702 1097 aa2.25□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 CLCN3P51790 818 aa2.25□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 LMO4P61968 165 aa2.25□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 CYP4A11Q02928 519 aa2.25□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP2.25□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 PMS2P11Q13670 270 aa2.25□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 TNFAIP1Q13829 316 aa2.25□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 LPAL2Q16609 132 aa2.25□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 ARL13BQ3SXY8 428 aa2.25□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 GXYLT1Q4G148 440 aa2.25□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 DCAF6Q58WW2 860 aa2.25□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 ODR4Q5SWX8 454 aa2.25□□□□□ -2.05
MRPS35P2-201ENST00000508242 LCE1CQ5T751 118 aa2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms