RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 MEIS3Q99687 375 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 PLCB1Q9NQ66 1216 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 PRDM8Q9NQV8 689 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 FBXO4Q9UKT5 387 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 ABCC11Q96J66 1382 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 KNDC1Q76NI1 1749 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 PPLO60437 1756 aa5.11□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 F5H423 210 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 RGS12O14924 1447 aa5.1□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 PEPDP12955 493 aa5.1□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 GYS1P13807 737 aa5.1□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 PKMP14618 531 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 MYOM2P54296 1465 aa5.1□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 RHAGQ02094 409 aa5.1□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 EGR4Q05215 589 aa5.1□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 GPR18Q14330 331 aa5.1□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 GXYLT1Q4G148 440 aa5.1□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 KLHL22Q53GT1 634 aa5.1□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 TTC22Q5TAA0 569 aa5.1□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 RTL10Q7L3V2 364 aa5.1□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 FAM217AQ8IXS0 508 aa5.1□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 FSIP1Q8NA03 581 aa5.1□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 ASB5Q8WWX0 329 aa5.1□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 CRB3Q9BUF7 120 aa5.1□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 MAP6D1Q9H9H5 199 aa5.1□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 FZD10Q9ULW2 581 aa5.1□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 MYO6Q9UM54 1294 aa5.1□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 DAPP1Q9UN19 280 aa5.1□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 PCDHA7Q9UN72 937 aa5.1□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 PIK3C2GO75747 1445 aa5.09□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 ATRNO75882 1429 aa5.09□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa5.09□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa5.09□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 OR6C75A6NL08 312 aa5.09□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 CSTBP04080 98 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 NGFRP08138 427 aa5.09□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 HOXC6P09630 235 aa5.09□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 ARSBP15848 533 aa5.09□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 ZXDBP98169 803 aa5.09□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 CDK18Q07002 472 aa5.09□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 DSC1Q08554 894 aa5.09□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 UBE4AQ14139 1066 aa5.09□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 PLK5Q496M5 336 aa5.09□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa5.09□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 Q6ZTK2 550 aa5.09□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 PALB2Q86YC2 1186 aa5.09□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 SAMD3Q8N6K7 520 aa5.09□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 KCNJ9Q92806 393 aa5.09□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa5.09□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 MYLK2Q9H1R3 596 aa5.09□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
RBM39-241ENST00000496183 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 PXDNQ92626 1479 aa5.08□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 ARHGEF10O15013 1369 aa5.08□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 GRM8O00222 908 aa5.08□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 ACKR2O00590 384 aa5.08□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 MYZAPP0CAP1 466 aa5.08□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 PRPH2P23942 346 aa5.08□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 TRAF2Q12933 501 aa5.08□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 CCDC38Q502W7 563 aa5.08□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa5.08□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 RUBCNQ92622 972 aa5.08□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 ARRDC3Q96B67 414 aa5.08□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 FRG2BQ96QU4 278 aa5.08□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa5.08□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 DCLK3Q9C098 648 aa5.08□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 B3GNT4Q9C0J1 378 aa5.08□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP5.08□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 HIPK3Q9H422 1215 aa5.08□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 ZNF304Q9HCX3 659 aa5.08□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 RAP2CQ9Y3L5 183 aa5.08□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 DLC1Q96QB1 1528 aa5.07□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 NRXN1Q9ULB1 1477 aa5.07□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 ANKARQ7Z5J8 1434 aa5.07□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 SBNO1A3KN83 1393 aa5.07□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 IFT172Q9UG01 1749 aa5.07□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 C17orf102A2RUQ5 167 aa5.07□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 HMX3A6NHT5 357 aa5.07□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 VWA5AO00534 786 aa5.07□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 TMCC1O94876 653 aa5.07□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 TFRCP02786 760 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 CYP4B1P13584 511 aa5.07□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 SERPINB3P29508 390 aa5.07□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 RPS6KA3P51812 740 aa5.07□□□□□ -1.6
RBM39-241ENST00000496183 ZP1P60852 638 aa5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms