RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DHDHQ9UQ10 334 aa4.85□□□□□ -1.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR6C75A6NL08 312 aa4.84□□□□□ -1.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MS4A18H0YCH9 400 aa4.84□□□□□ -1.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LDB2O43679 373 aa4.84□□□□□ -1.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CBX6O95503 412 aa4.84□□□□□ -1.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 THPOP40225 353 aa4.84□□□□□ -1.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ENTPD1P49961 510 aa4.84□□□□□ -1.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF284Q2VY69 593 aa4.84□□□□□ -1.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa4.84□□□□□ -1.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FNBP1LQ5T0N5 605 aa4.84□□□□□ -1.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANKRD45Q5TZF3 282 aa4.84□□□□□ -1.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FBXL14Q8N1E6 418 aa4.84□□□□□ -1.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IQCF1Q8N6M8 205 aa4.84□□□□□ -1.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANKRD44Q8N8A2 993 aa4.84□□□□□ -1.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TEX45Q8NA69 505 aa4.84□□□□□ -1.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TWNKQ96RR1 684 aa4.84□□□□□ -1.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLSTN3Q9BQT9 956 aa4.84□□□□□ -1.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZPBPQ9BS86 351 aa4.84□□□□□ -1.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM204Q9BSN7 226 aa4.84□□□□□ -1.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa4.84□□□□□ -1.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HIF1ANQ9NWT6 349 aa4.84□□□□□ -1.63
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CKAP5Q14008 2032 aa4.84□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VWA3AA6NCI4 1184 aa4.83□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM157AC9JC47 383 aa4.83□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HOXC6P09630 235 aa4.83□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLA2G2AP14555 144 aa4.83□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CD72P21854 359 aa4.83□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CDH12P55289 794 aa4.83□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HNF4GQ14541 408 aa4.83□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM163Q8TC26 289 aa4.83□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC35F5Q8WV83 523 aa4.83□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NOD2Q9HC29 1040 aa4.83□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WWOXQ9NZC7 414 aa4.83□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MYO6Q9UM54 1294 aa4.83□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM90A7PA6NKC0 464 aa4.82□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM90A22PA8MWA6 464 aa4.82□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM90A12PA8MX19 464 aa4.82□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa4.82□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LIASO43766 372 aa4.82□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC28A2O43868 658 aa4.82□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HBP1O60381 514 aa4.82□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SOX30O94993 753 aa4.82□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SERPINC1P01008 464 aa4.82□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 YWHAQP27348 245 aa4.82□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TNFRSF8P28908 595 aa4.82□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZXDBP98169 803 aa4.82□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LTBQ06643 244 aa4.82□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GOLGA8FQ08AF8 430 aa4.82□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPFIA1Q13136 1202 aa4.82□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC18A3Q16572 532 aa4.82□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ME3Q16798 604 aa4.82□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMC8Q8IU68 726 aa4.82□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RBFAQ8N0V3 343 aa4.82□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 USP38Q8NB14 1042 aa4.82□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa4.82□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FZD10Q9ULW2 581 aa4.82□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GDAQ9Y2T3 454 aa4.82□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LACTBL1A8MY62 500 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KLK10O43240 276 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ADAP00813 363 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MMP3P08254 477 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 T-ENOLP0DO92 83 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EGR4Q05215 589 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC18A2Q05940 514 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANKRD1Q15327 319 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANKRD42Q8N9B4 389 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NEUROG1Q92886 237 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM18Q96B42 140 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PHF21BQ96EK2 531 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 REEP2Q9BRK0 252 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MSTO1Q9BUK6 570 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LHPPQ9H008 270 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LMAN2LQ9H0V9 348 aa4.81□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VWA5AO00534 786 aa4.8□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PEX12O00623 359 aa4.8□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANP32CO43423 234 aa4.8□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IL1AP01583 271 aa4.8□□□□□ -1.64
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CENPAP49450 140 aa4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms