RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC53A6NM62 1247 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 TSPAN9O75954 239 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 MLYCDO95822 493 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 MAPK4P31152 587 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 ICAM3P32942 547 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 GABRB2P47870 512 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 OLR1P78380 273 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 FHL2Q14192 279 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 ISM2Q6H9L7 571 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 AAGABQ6PD74 315 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 GPR150Q8NGU9 434 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 GDPD5Q8WTR4 605 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 POMGNT1Q8WZA1 660 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 TBC1D29Q9UFV1 150 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRC-212ENST00000491302 NCANO14594 1321 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 NEURL1O76050 574 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 IGLV2-14P01704 120 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 SLC2A4P14672 509 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 CIITAP33076 1130 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 CLCNKBP51801 687 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 PMPCAQ10713 525 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 STIM1Q13586 685 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 PGM5Q15124 567 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM119Q4V9L6 283 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 ALG10Q5BKT4 473 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 RILPL1Q5EBL4 403 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 ALG10BQ5I7T1 473 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 TTC39AQ5SRH9 613 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 NCEH1Q6PIU2 408 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 MOB3CQ70IA8 216 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 GSTA5Q7RTV2 222 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC25Q86WR0 208 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 FAM185AQ8N0U4 392 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 TTC39CQ8N584 583 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 SCFD2Q8WU76 684 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 KAT2AQ92830 837 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 MAP7D2Q96T17 732 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 CXorf56Q9H5V9 222 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 A4GNTQ9UNA3 340 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 C2CD4BA6NLJ0 364 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 FAM157AC9JC47 383 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 LDLRAD4O15165 306 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 RNMTO43148 476 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 TMCC1O94876 653 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 PTPN2P17706 415 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 PTGER1P34995 402 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 GDF5P43026 501 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP10-2P60368 255 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 TFF2Q03403 129 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 CRYMQ14894 314 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 VEPH1Q14D04 833 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 WTAPQ15007 396 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 ME3Q16798 604 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 DPCR1Q3MIW9 517 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 FAM57BQ71RH2 274 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 GPAT4Q86UL3 456 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 TMC8Q8IU68 726 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 FRMD1Q8N878 549 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 HASPINQ8TF76 798 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 ERP27Q96DN0 273 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 FAM118BQ9BPY3 351 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 PIMREGQ9BSJ6 248 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 HEMGNQ9BXL5 484 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF304Q9HCX3 659 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 LAMP3Q9UQV4 416 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 LIPT2A6NK58 231 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 LINC01548A6NM66 108 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 PTGES3LE9PB15 166 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP8.12□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 TMCC2O75069 709 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 C1QL1O75973 258 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 HEXAP06865 529 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 RAD52P43351 418 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 PRAMEP78395 509 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 STRIP1Q5VSL9 837 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 PTF1AQ7RTS3 328 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 DPP10Q8N608 796 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 NELL1Q92832 810 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 DMRT1Q9Y5R6 373 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 WDR17Q8IZU2 1322 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 FOXO6A8MYZ6 492 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRC-212ENST00000491302 F8W810 466 aa8.11□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms