RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490653.1

PRPF4B-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 4B, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF4B, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4B-208ENST00000490653 HLA-BQ31612 363 aa7.51□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 CCDC14Q49A88 953 aa7.51□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 C5orf22Q49AR2 442 aa7.51□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 ACCSLQ4AC99 568 aa7.51□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 KIAA0895LQ68EN5 471 aa7.51□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 NCEH1Q6PIU2 408 aa7.51□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 C19orf48Q6RUI8 117 aa7.51□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 BNIPLQ7Z465 357 aa7.51□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 SLCO6A1Q86UG4 719 aa7.51□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 FAM131BQ86XD5 332 aa7.51□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 PROSER1Q86XN7 944 aa7.51□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 MARCH9Q86YJ5 346 aa7.51□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa7.51□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 NETO2Q8NC67 525 aa7.51□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 CHST14Q8NCH0 376 aa7.51□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 RXFP2Q8WXD0 754 aa7.51□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC6A18Q96N87 628 aa7.51□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 NOX5Q96PH1 765 aa7.51□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 C11orf70Q9BRQ4 267 aa7.51□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 GAREM1Q9H706 876 aa7.51□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa7.51□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 BTBD3Q9Y2F9 522 aa7.51□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 CEP83Q9Y592 693 aa7.51□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 PLXNA2O75051 1894 aa7.51□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 ITIH6Q6UXX5 1313 aa7.51□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 A0A1B0GVM2 712 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 TMEM8BA6NDV4 472 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 TCAF2A6NFQ2 919 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 LRRC10BA6NIK2 292 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 UPK3BL1B0FP48 263 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 UPK3BL2E5RIL1 263 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 E9PAM4 449 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 FAM72CH0Y354 149 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 H0Y8X5 98 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 ATP9BO43861 1147 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 CBFA2T3O75081 653 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 RTN2O75298 545 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 ENDOD1O94919 500 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 MOCS3O95396 460 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 CD160O95971 181 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 IL1BP01584 269 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 CTSLP07711 333 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 SRCP12931 536 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 GNSP15586 552 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 RRM1P23921 792 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 DRD3P35462 400 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 ACVRL1P37023 503 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 DPP6P42658 865 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 CDH4P55283 916 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 PPP2CBP62714 309 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 PPP2CAP67775 309 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 IL9RQ01113 521 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 CDR2Q01850 454 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 UBXN1Q04323 297 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 TYRO3Q06418 890 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 SHBQ15464 509 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 SLC25A52Q3SY17 297 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 SAMD5Q5TGI4 173 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 FAM72AQ5TYM5 149 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 FAM72DQ6L9T8 149 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 SASS6Q6UVJ0 657 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 LINGO4Q6UY18 593 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 FAM72BQ86X60 149 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 SH2D3CQ8N5H7 860 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 AOPEPQ8N6M6 819 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 OR14C36Q8NHC7 312 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 KLK6Q92876 244 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 ARRDC3Q96B67 414 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 CRELD1Q96HD1 420 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 OMDQ99983 421 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 TRIM62Q9BVG3 475 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 TNKS2Q9H2K2 1166 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 SGK2Q9HBY8 427 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 ANO10Q9NW15 660 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 TAS2R14Q9NYV8 317 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 ZNF212Q9UDV6 495 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 CA5BQ9Y2D0 317 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 DOCK4Q8N1I0 1966 aa7.5□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa7.49□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 A0A1W2PR77 199 aa7.49□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa7.49□□□□□ -1.21
PRPF4B-208ENST00000490653 LGALS16A8MUM7 142 aa7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms