RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488684.5

POLR2F-211, Transcript of RNA polymerase II subunit F, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR2F, Length 564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2F-211ENST00000488684 DNA2P51530 1060 aa22.84■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 CCDC14Q49A88 953 aa22.84■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 CARD16Q5EG05 197 aa22.84■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 MANEALQ5VSG8 457 aa22.84■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa22.84■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 RXFP2Q8WXD0 754 aa22.84■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 BMFQ96LC9 184 aa22.84■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 HEPHQ9BQS7 1158 aa22.84■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 CALN1Q9BXU9 219 aa22.84■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 OR12D3Q9UGF7 316 aa22.84■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 FAM72CH0Y354 149 aa22.83■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 GJB6O95452 261 aa22.83■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 ADRB3P13945 408 aa22.83■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 MMP8P22894 467 aa22.83■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 L1CAMP32004 1257 aa22.83■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 NEK3P51956 506 aa22.83■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 FMO1Q01740 532 aa22.83■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 CDR2Q01850 454 aa22.83■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 SEMG2Q02383 582 aa22.83■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 RTP5Q14D33 572 aa22.83■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 CDO1Q16878 200 aa22.83■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 FAM72AQ5TYM5 149 aa22.83■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 FAM72DQ6L9T8 149 aa22.83■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 FAM72BQ86X60 149 aa22.83■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 ZNF677Q86XU0 584 aa22.83■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 JOSD2Q8TAC2 188 aa22.83■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 SLC30A5Q8TAD4 765 aa22.83■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 RFFLQ8WZ73 363 aa22.83■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 PPP1R16AQ96I34 528 aa22.83■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 DCBLD2Q96PD2 775 aa22.83■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 SLC17A9Q9BYT1 436 aa22.83■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 VPS16Q9H269 839 aa22.83■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 FADS3Q9Y5Q0 445 aa22.83■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa22.83■■□□□ 1.25
POLR2F-211ENST00000488684 EPHB6O15197 1021 aa22.82■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 RAD51BO15315 384 aa22.82■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 ITGB7P26010 798 aa22.82■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 Q6ZSR6 202 aa22.82■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 NLRP14Q86W24 1093 aa22.82■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 OR4C6Q8NH72 309 aa22.82■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 GPT2Q8TD30 523 aa22.82■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 VOPP1Q96AW1 172 aa22.82■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 NRSN2Q9GZP1 204 aa22.82■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa22.82■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 AK5Q9Y6K8 562 aa22.82■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 POM121BA6NF01 834 aa22.81■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 FFAR2O15552 330 aa22.81■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 PIAS2O75928 621 aa22.81■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 ITPKBP27987 946 aa22.81■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 GKP32189 559 aa22.81■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 JAM2P57087 298 aa22.81■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 KRT31Q15323 416 aa22.81■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 ZNF542PQ5EBM4 170 aa22.81■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 CDKAL1Q5VV42 579 aa22.81■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa22.81■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 FEM1CQ96JP0 617 aa22.81■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 PCDHB18PQ96TA0 734 aa22.81■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 C11orf70Q9BRQ4 267 aa22.81■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 TM6SF2Q9BZW4 377 aa22.81■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 OSBPL2Q9H1P3 480 aa22.81■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 GPR27Q9NS67 375 aa22.81■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 DNAI1Q9UI46 699 aa22.81■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 NEU3Q9UQ49 428 aa22.81■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 CLCA2Q9UQC9 943 aa22.81■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 C2CD4BA6NLJ0 364 aa22.8■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 MYF5P13349 255 aa22.8■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 SDC4P31431 198 aa22.8■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 SOX5P35711 763 aa22.8■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 RPS21P63220 83 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 PTP4A2Q12974 167 aa22.8■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa22.8■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 TMC6Q7Z403 805 aa22.8■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 PLPP6Q8IY26 295 aa22.8■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa22.8■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 OR6K2Q8NGY2 324 aa22.8■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa22.8■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 NLRC4Q9NPP4 1024 aa22.8■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 A6NNZ2 444 aa22.79■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 AP1G1O43747 822 aa22.79■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 LRIG2O94898 1065 aa22.79■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 UNGP13051 313 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
POLR2F-211ENST00000488684 RHOQP17081 205 aa22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms